54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4866 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4866  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 387 aa  778    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4462  ABC-2 type transporter  90.18 
 
 		 382 aa  690    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.510043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3782  ABC-2 type transporter  78.55 
 
 		 378 aa  617  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4192  ABC-2 type transporter  77 
 
 		 381 aa  617  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148286  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0055  transport protein, putative  74.35 
 
 		 379 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0074  transport protein, putative  73.83 
 
 		 379 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000331098 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0072  transport protein, putative  73.83 
 
 		 379 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0069  transport protein, putative  73.83 
 
 		 379 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0069  transport protein, putative  72.28 
 
 		 379 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0070  transport protein, putative  73.32 
 
 		 379 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0074  transport protein, putative  72.28 
 
 		 379 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0071  transport protein, putative  72.02 
 
 		 379 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3979  ABC-2 type transporter  74.15 
 
 		 377 aa  568  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.508382  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4280  transport protein, putative  72.28 
 
 		 379 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0066  transport protein, putative  71.02 
 
 		 378 aa  550  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3577  transport protein, putative  66.58 
 
 		 378 aa  510  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0724  protein NatB  35.17 
 
 		 396 aa  230  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3872  ABC transporter sodium permease  34.36 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02800  ABC transporter sodium permease  31.31 
 
 		 397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1445  ABC transporter sodium permease  30.69 
 
 		 394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757965  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1500  ABC transporter sodium permease  30.69 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809114  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 394 aa  123  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  28.82 
 
 		 394 aa  119  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3799  Na+ ABC transporter permease protein  27.97 
 
 		 397 aa  113  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.578241  normal  0.0174839 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2943  ABC-2 type transporter  24.14 
 
 		 405 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0112  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  25.5 
 
 		 403 aa  90.1  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.06 
 
 		 397 aa  87  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  26.18 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1790  putative sodium ABC transporter permease protein  24.39 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1676  ABC-2 type transporter  22.1 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1957  ABC-2 type transporter  27.41 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0574803  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 405 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.06 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1131  ABC-2 type transporter  24.63 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.315475  hitchhiker  0.00237195 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  25.91 
 
 		 775 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 380 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  24.92 
 
 		 376 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  26.03 
 
 		 380 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19720  hypothetical protein  27.7 
 
 		 157 aa  53.1  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  23.81 
 
 		 830 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0209  conserved hypothetical protein  24.01 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  23.55 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3196  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  29.07 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109527 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3735  heavy metal efflux pump CzcA  28.29 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  22.73 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  21.27 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  21.82 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  22.26 
 
 		 377 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  21.97 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  25.11 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  21.48 
 
 		 377 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  24.17 
 
 		 368 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0757  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  26.03 
 
 		 367 aa  43.1  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.329379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>