214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0112 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0112  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  100 
 
 		 403 aa  800    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  43.97 
 
 		 394 aa  344  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  44.47 
 
 		 394 aa  344  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2943  ABC-2 type transporter  34.98 
 
 		 405 aa  256  7e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  30.34 
 
 		 409 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1790  putative sodium ABC transporter permease protein  27.67 
 
 		 395 aa  166  9e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  28.22 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  30.12 
 
 		 398 aa  150  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1957  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 		 388 aa  133  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0574803  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1676  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02800  ABC transporter sodium permease  25.31 
 
 		 397 aa  122  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3196  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.83 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109527 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4192  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 		 381 aa  117  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148286  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1445  ABC transporter sodium permease  27 
 
 		 394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757965  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3872  ABC transporter sodium permease  22.06 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1500  ABC transporter sodium permease  27 
 
 		 394 aa  113  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809114  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3979  ABC-2 type transporter  28.33 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.508382  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4462  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.510043 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  29.55 
 
 		 830 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0055  transport protein, putative  26.54 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0069  transport protein, putative  27.21 
 
 		 379 aa  106  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0069  transport protein, putative  26.78 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0074  transport protein, putative  26.29 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0071  transport protein, putative  27.03 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4280  transport protein, putative  26.29 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 405 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0074  transport protein, putative  26.96 
 
 		 379 aa  103  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000331098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0070  transport protein, putative  26.85 
 
 		 379 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0072  transport protein, putative  26.96 
 
 		 379 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0724  protein NatB  24.68 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3782  ABC-2 type transporter  26.57 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4866  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 387 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3799  Na+ ABC transporter permease protein  27.27 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.578241  normal  0.0174839 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3577  transport protein, putative  27.09 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0066  transport protein, putative  26.77 
 
 		 378 aa  96.7  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  32.72 
 
 		 775 aa  95.9  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1131  ABC-2 type transporter  21.36 
 
 		 390 aa  86.7  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.315475  hitchhiker  0.00237195 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  31.89 
 
 		 364 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3735  heavy metal efflux pump CzcA  22.41 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  23.11 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19710  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  24.54 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  22.05 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  25.39 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  21.48 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4575  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.12 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1421  ABC-2 type transporter  23.74 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4677  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.521717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  21.16 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  25.1 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  22.78 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  24.18 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  20.38 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  22.57 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  22.39 
 
 		 383 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  23 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  24.03 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  23.21 
 
 		 356 aa  57  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  23.68 
 
 		 370 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  22.44 
 
 		 376 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  22.87 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  23.23 
 
 		 375 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8102  ABC-2 type transporter  20.23 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0896  ABC-2 type transporter  22.37 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  22.65 
 
 		 380 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  22.35 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1173  ABC-2 type transporter  21.16 
 
 		 437 aa  55.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  21.7 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  22.76 
 
 		 368 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  22.76 
 
 		 368 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  22.35 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  22.76 
 
 		 368 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  22.76 
 
 		 368 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  22.76 
 
 		 368 aa  54.7  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  22.76 
 
 		 368 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  22.76 
 
 		 368 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  22.76 
 
 		 368 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  21.64 
 
 		 368 aa  54.3  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 368 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  21.83 
 
 		 366 aa  54.3  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  23.33 
 
 		 368 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  23.95 
 
 		 379 aa  53.9  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  22.7 
 
 		 382 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0699  hypothetical protein  23.71 
 
 		 403 aa  53.1  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.513014  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  20.62 
 
 		 376 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0704  hypothetical protein  23.71 
 
 		 403 aa  53.1  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  20.62 
 
 		 376 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  20.62 
 
 		 376 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  20.62 
 
 		 376 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  25.17 
 
 		 371 aa  53.1  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  22.14 
 
 		 383 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  21.09 
 
 		 377 aa  53.1  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>