86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02800 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02800  ABC transporter sodium permease  100 
 
 		 397 aa  787    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3872  ABC transporter sodium permease  72.52 
 
 		 394 aa  585  1e-166  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1500  ABC transporter sodium permease  67.86 
 
 		 394 aa  494  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809114  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1445  ABC transporter sodium permease  67.6 
 
 		 394 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757965  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4866  ABC-2 type transporter  32.14 
 
 		 387 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4462  ABC-2 type transporter  33.7 
 
 		 382 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.510043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3782  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 		 378 aa  159  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4192  ABC-2 type transporter  32.1 
 
 		 381 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148286  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  25.9 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0066  transport protein, putative  31.28 
 
 		 378 aa  152  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0055  transport protein, putative  28.87 
 
 		 379 aa  150  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  24.62 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0074  transport protein, putative  28.35 
 
 		 379 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0069  transport protein, putative  28.35 
 
 		 379 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4280  transport protein, putative  28.09 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0071  transport protein, putative  28.46 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0069  transport protein, putative  28.72 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0070  transport protein, putative  28.61 
 
 		 379 aa  139  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0074  transport protein, putative  28.61 
 
 		 379 aa  139  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000331098 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0724  protein NatB  27.79 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0072  transport protein, putative  28.61 
 
 		 379 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2943  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3577  transport protein, putative  30.08 
 
 		 378 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3979  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.508382  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0112  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  25.56 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3799  Na+ ABC transporter permease protein  31.92 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.578241  normal  0.0174839 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  24.13 
 
 		 409 aa  110  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  26.06 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1790  putative sodium ABC transporter permease protein  29.06 
 
 		 395 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  23.17 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1131  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 		 390 aa  90.1  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.315475  hitchhiker  0.00237195 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1676  ABC-2 type transporter  28.36 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  23.37 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1957  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0574803  normal  0.493307 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  27.59 
 
 		 830 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  25.9 
 
 		 775 aa  77  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3735  heavy metal efflux pump CzcA  22.12 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3196  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  26.74 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109527 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 383 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19710  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  30.2 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  26.54 
 
 		 379 aa  53.9  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  21.43 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  22.5 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19720  hypothetical protein  25.33 
 
 		 157 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 		 365 aa  50.8  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  21.69 
 
 		 381 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  27.27 
 
 		 371 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1421  ABC-2 type transporter  22.54 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  20.71 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  22.87 
 
 		 378 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  20.4 
 
 		 381 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  23.94 
 
 		 370 aa  47  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  26.59 
 
 		 405 aa  46.6  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1684  ABC-2 type transporter  42.47 
 
 		 243 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  41.27 
 
 		 359 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1641  multidrug ABC transporter, permease  21.79 
 
 		 381 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000991751  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  23.57 
 
 		 380 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1843  hypothetical protein  21.79 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1663  hypothetical protein  21.79 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0766835  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  22.8 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  22.8 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  22.8 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  22.8 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  22.8 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1795  hypothetical protein  21.79 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  24.9 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  22.95 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  23.85 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  22.92 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  22.18 
 
 		 366 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 378 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1866  ABC transporter, permease protein  27.69 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  24.8 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  21.96 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  21.07 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  25.3 
 
 		 385 aa  44.3  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1805  ABC transporter, permease protein  27.69 
 
 		 369 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 388 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0143  hypothetical protein  23.6 
 
 		 359 aa  43.5  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467996  decreased coverage  0.00277637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  24.6 
 
 		 368 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1609  multidrug ABC transporter, permease  26.92 
 
 		 369 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  24.51 
 
 		 377 aa  43.1  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>