18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0618 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0618  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  100 
 
 		 391 aa  754    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.873609 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0209  conserved hypothetical protein  48.74 
 
 		 396 aa  324  2e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  26.43 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  26.06 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  26.09 
 
 		 369 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  25.75 
 
 		 369 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3872  ABC transporter sodium permease  24.85 
 
 		 394 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1421  ABC-2 type transporter  22.81 
 
 		 415 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  22.38 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0112  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  23.83 
 
 		 403 aa  47.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  24.31 
 
 		 380 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  21.64 
 
 		 775 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  25 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  23.74 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  33.96 
 
 		 232 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  23.08 
 
 		 379 aa  43.5  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  22.88 
 
 		 369 aa  43.1  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>