42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1421 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1421  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 415 aa  827    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0394  ABC-2 type transporter  36.05 
 
 		 412 aa  222  8e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1565  ABC-2 type transporter  28.6 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000580039  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.48 
 
 		 409 aa  93.6  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1173  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 		 437 aa  88.6  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  22.35 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.13 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  24.75 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  25.06 
 
 		 394 aa  67  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0213  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.05 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.331802  normal  0.747646 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0112  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  23.51 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0209  conserved hypothetical protein  24.26 
 
 		 396 aa  57  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1740  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  25.28 
 
 		 441 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1131  ABC-2 type transporter  23.97 
 
 		 390 aa  50.1  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.315475  hitchhiker  0.00237195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7296  hypothetical protein  21.09 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  25.54 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1676  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5048  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  23.46 
 
 		 438 aa  47.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.626469  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2943  ABC-2 type transporter  20.67 
 
 		 405 aa  47.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1500  ABC transporter sodium permease  22.66 
 
 		 394 aa  47.4  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809114  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  24.64 
 
 		 369 aa  47  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1445  ABC transporter sodium permease  24.33 
 
 		 394 aa  47  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757965  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3144  Abortive infection protein  27.19 
 
 		 830 aa  47  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569126  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5192  bacitracin transport permease protein BCRB  31.4 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  22.78 
 
 		 775 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1790  putative sodium ABC transporter permease protein  26.25 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1178  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  25.95 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0911263  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0209  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 393 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  21.15 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0618  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  22.72 
 
 		 391 aa  43.9  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.873609 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  23.14 
 
 		 360 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4844  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 375 aa  43.9  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  21.49 
 
 		 372 aa  43.5  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3920  bacitracin transport permease protein BCRB  30.23 
 
 		 330 aa  43.5  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5429  ABC transporter, permease protein  30.23 
 
 		 330 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5522  ABC transporter, permease protein  30.23 
 
 		 330 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5494  ABC transporter, permease protein  30.23 
 
 		 330 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5097  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  30.23 
 
 		 330 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5080  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  30.23 
 
 		 330 aa  43.1  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0496537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5578  ABC transporter, permease protein  30.23 
 
 		 330 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5528  ABC transporter, permease protein  30.23 
 
 		 330 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2902  ABC-2 type transporter  24.93 
 
 		 391 aa  43.1  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>