68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7296 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7296  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  885    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1740  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  42.32 
 
 		 441 aa  348  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4966  ABC transporter, permease protein, putative  41.39 
 
 		 439 aa  334  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0945  ABC transporter, permease protein, putative  35.41 
 
 		 442 aa  277  3e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0199205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5048  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  37.39 
 
 		 438 aa  266  7e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.626469  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08266  ABC transporter, permease protein, putative  34.61 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2039  ABC-2 type transporter  34.69 
 
 		 424 aa  252  1e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2404  hypothetical protein  34.85 
 
 		 429 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.398451  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4513  hypothetical protein  31.39 
 
 		 432 aa  202  9e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.2961  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0486  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  29.35 
 
 		 419 aa  197  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1046  hypothetical protein  25.39 
 
 		 429 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.75067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3327  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  26.48 
 
 		 411 aa  139  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.63317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4635  hypothetical protein  28.13 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0635  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  25.28 
 
 		 412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000153887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4621  hypothetical protein  27.22 
 
 		 406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4256  hypothetical protein  27.22 
 
 		 406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.199751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4744  hypothetical protein  26.91 
 
 		 406 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4404  hypothetical protein  26.91 
 
 		 406 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3209  sodium export permease protein  24.62 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1946  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1451  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  25.62 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0108  putative ABC transporter  25.99 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.850247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0532  ABC-type Na+ efflux pump permease component  25.4 
 
 		 413 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00136958  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0704  hypothetical protein  30.19 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0699  hypothetical protein  29.92 
 
 		 403 aa  110  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.513014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4022  ABC transporter, permease component, putative sodium exporter  21.84 
 
 		 413 aa  110  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1178  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  23.99 
 
 		 426 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0911263  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0852  sodium extrusion protein NatB, putative  24.67 
 
 		 416 aa  109  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.5876  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2673  putative ABC-2 type transport system permease protein  22.75 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.270062  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0731  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  22.7 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_756  ABC transporter, permease protein  24.06 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0135656  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4617  sodium export permease protein  24.17 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0618  sodium export permease protein  24.17 
 
 		 408 aa  104  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1273  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  26.29 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0771  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  24.24 
 
 		 405 aa  101  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30220  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  28.63 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.861624  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2558  hypothetical protein  23.3 
 
 		 466 aa  95.9  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.246034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2601  putative ABC transporter permease  25.89 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.242329 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4244  hypothetical protein  26.35 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.256998  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4637  sodium export permease protein  26.35 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4337  ABC-2 type transport system permease protein  25.34 
 
 		 407 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2425  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  23.39 
 
 		 400 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5257  hypothetical protein  22.52 
 
 		 406 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2712  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  27.09 
 
 		 413 aa  92  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0836  ABC transporter permease  25.23 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1116  Na+ efflux pump ABC transporter permease-like protein  25.35 
 
 		 358 aa  87.8  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.139132 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1452  putative ABC-2 type transport system permease protein  22.83 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.75331  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1059  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  25.86 
 
 		 457 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.163235  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2410  hypothetical protein  21.02 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0745502  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2365  hypothetical protein  21.02 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1945  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.645504  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2674  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  27.78 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402271  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0905  Na+ efflux pump ABC transporter permease-like protein  22.22 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.17496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1730  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  21.09 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000352957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1384  putative ABC transporter permease  26.62 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.378059  normal  0.872307 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3999  ATP-dependent Na+ efflux pump  23.04 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.241363 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0859  putative Na+ efflux ABC transporter, permease component  23.19 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00918968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4173  putative ABC transporter  23.74 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3474  ATP-dependent Na+ efflux pump  22.43 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6163  ABC transporter permease  24.07 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0582  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  24.65 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1058  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  24.19 
 
 		 445 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00865226  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2866  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  22.61 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.650655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2743  ABC-type Na+ efflux pump permease component  20.97 
 
 		 360 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306664  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3030  putative Na+ efflux ABC transporter, permease component  22.63 
 
 		 377 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.509957  hitchhiker  0.000114076 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1421  ABC-2 type transporter  21.09 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0360  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.62 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1807  ATP-dependent Na+ efflux pump  24.32 
 
 		 432 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000010693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>