78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2601 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2601  putative ABC transporter permease  100 
 
 		 412 aa  768    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.242329 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0108  putative ABC transporter  51.61 
 
 		 438 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.850247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30220  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  44.66 
 
 		 407 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.861624  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0532  ABC-type Na+ efflux pump permease component  45.09 
 
 		 413 aa  270  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00136958  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2712  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  46.48 
 
 		 413 aa  236  4e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1946  ABC-2 type transporter  38.61 
 
 		 400 aa  216  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1273  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  37.06 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0731  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  35.75 
 
 		 390 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0836  ABC transporter permease  37.28 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2404  hypothetical protein  34.68 
 
 		 429 aa  150  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.398451  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0859  putative Na+ efflux ABC transporter, permease component  31.58 
 
 		 368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00918968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1116  Na+ efflux pump ABC transporter permease-like protein  32.41 
 
 		 358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.139132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0582  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  30.3 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0635  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  26.67 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000153887  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1451  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  28.72 
 
 		 409 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0905  Na+ efflux pump ABC transporter permease-like protein  34.91 
 
 		 366 aa  126  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.17496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2743  ABC-type Na+ efflux pump permease component  31.65 
 
 		 360 aa  126  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306664  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1384  putative ABC transporter permease  31.74 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.378059  normal  0.872307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1794  hypothetical protein  33.59 
 
 		 353 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3030  putative Na+ efflux ABC transporter, permease component  32.49 
 
 		 377 aa  121  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.509957  hitchhiker  0.000114076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6163  ABC transporter permease  32.06 
 
 		 371 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4966  ABC transporter, permease protein, putative  25 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1780  hypothetical protein  34.35 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2039  ABC-2 type transporter  24.76 
 
 		 424 aa  117  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7296  hypothetical protein  26.12 
 
 		 437 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4513  hypothetical protein  31.25 
 
 		 432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.2961  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4173  putative ABC transporter  31.74 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08266  ABC transporter, permease protein, putative  25.17 
 
 		 433 aa  113  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1740  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  26.16 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3209  sodium export permease protein  24.94 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26820  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  28.54 
 
 		 379 aa  106  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749324  normal  0.452605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5048  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  22.77 
 
 		 438 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.626469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0486  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  24.2 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4022  ABC transporter, permease component, putative sodium exporter  22.11 
 
 		 413 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5257  hypothetical protein  29.18 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0945  ABC transporter, permease protein, putative  24.22 
 
 		 442 aa  97.4  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0199205 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4635  hypothetical protein  24.61 
 
 		 406 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4621  hypothetical protein  23.41 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4744  hypothetical protein  23.41 
 
 		 406 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1178  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  26.91 
 
 		 426 aa  94.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0911263  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4404  hypothetical protein  23.41 
 
 		 406 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4256  hypothetical protein  23.41 
 
 		 406 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.199751  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1046  hypothetical protein  23.26 
 
 		 429 aa  93.6  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.75067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0699  hypothetical protein  27.7 
 
 		 403 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.513014  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0704  hypothetical protein  27.7 
 
 		 403 aa  89.7  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3999  ATP-dependent Na+ efflux pump  26.18 
 
 		 406 aa  87  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.241363 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0618  sodium export permease protein  24.06 
 
 		 408 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4617  sodium export permease protein  27.85 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3327  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  25.98 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.63317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4244  hypothetical protein  27.52 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.256998  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4637  sodium export permease protein  27.52 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4337  ABC-2 type transport system permease protein  27.98 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2425  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  29.22 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741043  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2674  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  31.51 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402271  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0852  sodium extrusion protein NatB, putative  25.98 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.5876  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2410  hypothetical protein  25.11 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0745502  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2365  hypothetical protein  25.11 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1452  putative ABC-2 type transport system permease protein  21.89 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.75331  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0771  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  24.4 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_756  ABC transporter, permease protein  26.06 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0135656  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2558  hypothetical protein  24.82 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.246034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2673  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.64 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.270062  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0228  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  23.51 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1730  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  20.3 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000352957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1059  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  23.42 
 
 		 457 aa  67  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.163235  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3474  ATP-dependent Na+ efflux pump  25.91 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33500  hypothetical protein  27.55 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.178585  normal  0.421552 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1058  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  25.96 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00865226  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1807  ATP-dependent Na+ efflux pump  28.35 
 
 		 432 aa  57  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000010693 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0360  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.62 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1945  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.56 
 
 		 453 aa  50.8  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.645504  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1533  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.75 
 
 		 414 aa  47.4  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  27.19 
 
 		 373 aa  47  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  25.88 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  26.96 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 		 373 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 		 373 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 		 373 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>