73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2425 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2425  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  100 
 
 		 400 aa  784    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741043  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2673  putative ABC-2 type transport system permease protein  39.1 
 
 		 412 aa  260  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.270062  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0771  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  30.83 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0852  sodium extrusion protein NatB, putative  30.49 
 
 		 416 aa  182  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.5876  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_756  ABC transporter, permease protein  31.07 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0135656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1046  hypothetical protein  30.19 
 
 		 429 aa  176  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.75067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3327  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  31.1 
 
 		 411 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.63317  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2674  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  31.41 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402271  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4966  ABC transporter, permease protein, putative  26.59 
 
 		 439 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0945  ABC transporter, permease protein, putative  24.67 
 
 		 442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0199205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5048  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  26.13 
 
 		 438 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.626469  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2404  hypothetical protein  26.04 
 
 		 429 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.398451  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4513  hypothetical protein  26.59 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.2961  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08266  ABC transporter, permease protein, putative  24.83 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2039  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 		 424 aa  109  8.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1740  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  24.09 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7296  hypothetical protein  23.39 
 
 		 437 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0108  putative ABC transporter  27.9 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.850247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3474  ATP-dependent Na+ efflux pump  23.71 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0635  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  23.1 
 
 		 412 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000153887  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0486  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  22.05 
 
 		 419 aa  93.6  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0532  ABC-type Na+ efflux pump permease component  26.05 
 
 		 413 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00136958  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3999  ATP-dependent Na+ efflux pump  24.39 
 
 		 406 aa  93.2  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.241363 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1452  putative ABC-2 type transport system permease protein  23.3 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.75331  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2743  ABC-type Na+ efflux pump permease component  27.85 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306664  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1451  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  21.98 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5257  hypothetical protein  25.75 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0859  putative Na+ efflux ABC transporter, permease component  26.45 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00918968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1178  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  22.87 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0911263  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1807  ATP-dependent Na+ efflux pump  22.77 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000010693 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2601  putative ABC transporter permease  29.22 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.242329 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1116  Na+ efflux pump ABC transporter permease-like protein  26.57 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.139132 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1273  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  25.6 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0699  hypothetical protein  24.17 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.513014  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0704  hypothetical protein  24.17 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1946  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0731  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  25.25 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4256  hypothetical protein  26.16 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.199751  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30220  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  29.41 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.861624  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3209  sodium export permease protein  24.59 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4621  hypothetical protein  26.16 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4744  hypothetical protein  26.16 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0905  Na+ efflux pump ABC transporter permease-like protein  22.83 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.17496  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4404  hypothetical protein  26.16 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4337  ABC-2 type transport system permease protein  25.6 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26820  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  24.43 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749324  normal  0.452605 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4635  hypothetical protein  24.89 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4244  hypothetical protein  24.91 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.256998  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4637  sodium export permease protein  24.91 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2712  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  25.25 
 
 		 413 aa  66.2  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4173  putative ABC transporter  28.83 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4617  sodium export permease protein  24.79 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0618  sodium export permease protein  24.79 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4022  ABC transporter, permease component, putative sodium exporter  21.64 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2558  hypothetical protein  26.4 
 
 		 466 aa  62  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.246034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3030  putative Na+ efflux ABC transporter, permease component  26.56 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.509957  hitchhiker  0.000114076 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1059  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  24.18 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.163235  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2365  hypothetical protein  21.45 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2410  hypothetical protein  21.45 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0745502  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6163  ABC transporter permease  24.42 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1730  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  24.74 
 
 		 411 aa  53.5  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000352957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1794  hypothetical protein  24.87 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0836  ABC transporter permease  30.26 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1384  putative ABC transporter permease  23.89 
 
 		 405 aa  51.2  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.378059  normal  0.872307 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0219  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  22.4 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.444112  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  24.13 
 
 		 366 aa  47.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1533  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  24.23 
 
 		 414 aa  46.6  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1945  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  22.82 
 
 		 453 aa  46.6  0.0009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.645504  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  27.64 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1780  hypothetical protein  27.78 
 
 		 353 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  25.61 
 
 		 366 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4313  extracellular solute-binding protein  36.51 
 
 		 278 aa  43.5  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.438014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  29.63 
 
 		 415 aa  43.1  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>