71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_756 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0852  sodium extrusion protein NatB, putative  87.16 
 
 		 416 aa  735    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.5876  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0771  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  91.85 
 
 		 405 aa  751    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_756  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 405 aa  806    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0135656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1046  hypothetical protein  35.08 
 
 		 429 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.75067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2425  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  30.58 
 
 		 400 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741043  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2673  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.67 
 
 		 412 aa  172  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.270062  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3327  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  29.71 
 
 		 411 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.63317  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08266  ABC transporter, permease protein, putative  28.12 
 
 		 433 aa  139  7e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4966  ABC transporter, permease protein, putative  26.13 
 
 		 439 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5048  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  26.91 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.626469  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2039  ABC-2 type transporter  25.41 
 
 		 424 aa  137  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2674  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  28.25 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402271  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1452  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.18 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.75331  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1740  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  26.23 
 
 		 441 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4513  hypothetical protein  25.94 
 
 		 432 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.2961  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_002950  PG0945  ABC transporter, permease protein, putative  26.85 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0199205 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2404  hypothetical protein  28.25 
 
 		 429 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.398451  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0486  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  26.56 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0635  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  25.84 
 
 		 412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000153887  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3999  ATP-dependent Na+ efflux pump  27.78 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.241363 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1451  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  26 
 
 		 409 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7296  hypothetical protein  24.06 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0108  putative ABC transporter  27.6 
 
 		 438 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.850247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1178  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  24.19 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0911263  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1946  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 400 aa  97.1  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4022  ABC transporter, permease component, putative sodium exporter  26.63 
 
 		 413 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3474  ATP-dependent Na+ efflux pump  22.55 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0859  putative Na+ efflux ABC transporter, permease component  23.44 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00918968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0731  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  24.76 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1116  Na+ efflux pump ABC transporter permease-like protein  25.91 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.139132 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4173  putative ABC transporter  29.63 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1807  ATP-dependent Na+ efflux pump  25.67 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000010693 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2712  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  29.91 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30220  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  27.59 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.861624  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1273  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  25.61 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0704  hypothetical protein  28.79 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0699  hypothetical protein  28.28 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.513014  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1058  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  23.11 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00865226  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0532  ABC-type Na+ efflux pump permease component  24.19 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00136958  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2558  hypothetical protein  26.46 
 
 		 466 aa  69.3  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.246034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5257  hypothetical protein  26.29 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2365  hypothetical protein  21.23 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2410  hypothetical protein  21.23 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0745502  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4635  hypothetical protein  24.57 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2601  putative ABC transporter permease  30.35 
 
 		 412 aa  62.8  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.242329 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2743  ABC-type Na+ efflux pump permease component  29.83 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6163  ABC transporter permease  28.63 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19888  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4404  hypothetical protein  25.32 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4256  hypothetical protein  25.32 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.199751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4744  hypothetical protein  25.32 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4621  hypothetical protein  25.32 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1780  hypothetical protein  30.8 
 
 		 353 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1384  putative ABC transporter permease  24.09 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.378059  normal  0.872307 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1059  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  19.94 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.163235  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2866  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  29.11 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.650655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1794  hypothetical protein  29.46 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3209  sodium export permease protein  24.14 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0219  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  24.62 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.444112  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3030  putative Na+ efflux ABC transporter, permease component  25.22 
 
 		 377 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.509957  hitchhiker  0.000114076 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0228  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  23.46 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0360  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  20.39 
 
 		 406 aa  53.1  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4337  ABC-2 type transport system permease protein  23.65 
 
 		 407 aa  50.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0905  Na+ efflux pump ABC transporter permease-like protein  25.22 
 
 		 366 aa  47.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.17496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26820  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  27.92 
 
 		 379 aa  47  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749324  normal  0.452605 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4617  sodium export permease protein  23.61 
 
 		 408 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0618  sodium export permease protein  23.61 
 
 		 408 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0836  ABC transporter permease  27.6 
 
 		 395 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0582  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  30.3 
 
 		 387 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4637  sodium export permease protein  24.58 
 
 		 407 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4244  hypothetical protein  24.58 
 
 		 407 aa  43.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.256998  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1730  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  28.79 
 
 		 411 aa  43.1  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000352957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>