47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2866 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2866  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  100 
 
 		 414 aa  790    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.650655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0219  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  37.81 
 
 		 414 aa  216  8e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.444112  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1046  hypothetical protein  23.61 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.75067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08266  ABC transporter, permease protein, putative  22.49 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2558  hypothetical protein  29.88 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.246034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0486  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  23.56 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0945  ABC transporter, permease protein, putative  21.3 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0199205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4966  ABC transporter, permease protein, putative  21.66 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0704  hypothetical protein  25.51 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1740  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  22.86 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0852  sodium extrusion protein NatB, putative  30.52 
 
 		 416 aa  69.7  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.5876  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0771  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  32.41 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0699  hypothetical protein  25.1 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.513014  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2404  hypothetical protein  23.27 
 
 		 429 aa  67  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.398451  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1178  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  24.36 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0911263  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7296  hypothetical protein  21.2 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_756  ABC transporter, permease protein  30.09 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0135656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2365  hypothetical protein  22.59 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2410  hypothetical protein  22.59 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0745502  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2673  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.68 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.270062  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5048  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  23.19 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.626469  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4513  hypothetical protein  21.21 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.2961  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3327  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  26.29 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.63317  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1452  putative ABC-2 type transport system permease protein  19.39 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.75331  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3209  sodium export permease protein  22.13 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0731  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  24.47 
 
 		 390 aa  57  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1451  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  23.31 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4744  hypothetical protein  22.65 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4404  hypothetical protein  22.65 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4621  hypothetical protein  23.17 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4256  hypothetical protein  23.17 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.199751  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4635  hypothetical protein  22.46 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2039  ABC-2 type transporter  21.52 
 
 		 424 aa  53.9  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4173  putative ABC transporter  24.69 
 
 		 390 aa  53.1  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0635  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  24.1 
 
 		 412 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000153887  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0108  putative ABC transporter  26.75 
 
 		 438 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.850247  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1116  Na+ efflux pump ABC transporter permease-like protein  23.81 
 
 		 358 aa  49.7  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.139132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0532  ABC-type Na+ efflux pump permease component  25.39 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00136958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2425  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  25.23 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741043  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3999  ATP-dependent Na+ efflux pump  27.44 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.241363 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26820  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  29.06 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749324  normal  0.452605 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1533  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  22.78 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0582  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  22.48 
 
 		 387 aa  47  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3474  ATP-dependent Na+ efflux pump  25.1 
 
 		 430 aa  47  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1946  ABC-2 type transporter  22.86 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1058  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  22.27 
 
 		 445 aa  43.9  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00865226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4022  ABC transporter, permease component, putative sodium exporter  20.31 
 
 		 413 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>