104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2673 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2673  putative ABC-2 type transport system permease protein  100 
 
 		 412 aa  827    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.270062  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2425  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  39.1 
 
 		 400 aa  262  8e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741043  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1046  hypothetical protein  32.2 
 
 		 429 aa  203  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.75067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3327  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  31.19 
 
 		 411 aa  183  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.63317  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0852  sodium extrusion protein NatB, putative  30.1 
 
 		 416 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.5876  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0771  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  29.24 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_756  ABC transporter, permease protein  29.67 
 
 		 405 aa  180  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0135656  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4966  ABC transporter, permease protein, putative  28.6 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2404  hypothetical protein  30.63 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.398451  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4513  hypothetical protein  27.13 
 
 		 432 aa  153  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.2961  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2674  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  30.09 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402271  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0945  ABC transporter, permease protein, putative  26.86 
 
 		 442 aa  146  5e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0199205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1740  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  27.07 
 
 		 441 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2039  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 		 424 aa  139  7e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0635  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  25.77 
 
 		 412 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000153887  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08266  ABC transporter, permease protein, putative  27.72 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5048  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  25.22 
 
 		 438 aa  132  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.626469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1451  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  25.8 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1452  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.25 
 
 		 411 aa  124  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.75331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4022  ABC transporter, permease component, putative sodium exporter  23.64 
 
 		 413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7296  hypothetical protein  22.52 
 
 		 437 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0486  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  29.55 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0731  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  25.13 
 
 		 390 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3999  ATP-dependent Na+ efflux pump  23.32 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.241363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0108  putative ABC transporter  26.23 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.850247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0699  hypothetical protein  27.52 
 
 		 403 aa  106  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.513014  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0704  hypothetical protein  27.52 
 
 		 403 aa  106  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1946  ABC-2 type transporter  26.38 
 
 		 400 aa  103  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3474  ATP-dependent Na+ efflux pump  23.13 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1807  ATP-dependent Na+ efflux pump  24.2 
 
 		 432 aa  99  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000010693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0532  ABC-type Na+ efflux pump permease component  26.8 
 
 		 413 aa  97.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00136958  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30220  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.8 
 
 		 407 aa  94  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.861624  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1178  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  29.96 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0911263  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2558  hypothetical protein  24.24 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.246034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1116  Na+ efflux pump ABC transporter permease-like protein  31.88 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.139132 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5257  hypothetical protein  28.68 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3209  sodium export permease protein  24.79 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2712  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  30.17 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0905  Na+ efflux pump ABC transporter permease-like protein  26.08 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.17496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1273  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  23.13 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4635  hypothetical protein  26.64 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2365  hypothetical protein  23.3 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2410  hypothetical protein  23.3 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0745502  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2601  putative ABC transporter permease  27.06 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.242329 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1730  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  22.73 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000352957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1384  putative ABC transporter permease  25.97 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.378059  normal  0.872307 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4404  hypothetical protein  23.28 
 
 		 406 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4256  hypothetical protein  23.28 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.199751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4744  hypothetical protein  23.28 
 
 		 406 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0618  sodium export permease protein  23.5 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4621  hypothetical protein  23.28 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4617  sodium export permease protein  23.5 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2866  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  25.68 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.650655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4173  putative ABC transporter  25.57 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4337  ABC-2 type transport system permease protein  23.23 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1945  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  24.7 
 
 		 453 aa  63.2  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.645504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6163  ABC transporter permease  28.05 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19888  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4244  hypothetical protein  24.73 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.256998  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4637  sodium export permease protein  24.73 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0360  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  24.05 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0859  putative Na+ efflux ABC transporter, permease component  21.75 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00918968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2743  ABC-type Na+ efflux pump permease component  25.49 
 
 		 360 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306664  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0228  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  22.07 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  24.9 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0582  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  28.33 
 
 		 387 aa  53.5  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.95 
 
 		 384 aa  53.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  23.62 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  23.55 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3030  putative Na+ efflux ABC transporter, permease component  25.76 
 
 		 377 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.509957  hitchhiker  0.000114076 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1780  hypothetical protein  27.75 
 
 		 353 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1794  hypothetical protein  27.75 
 
 		 353 aa  51.2  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  34.65 
 
 		 373 aa  50.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  33.59 
 
 		 373 aa  49.7  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  34.65 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  34.65 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  34.65 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  34.65 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0219  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  25.81 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.444112  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  32.81 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  28.04 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26820  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  22.42 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749324  normal  0.452605 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  32.81 
 
 		 373 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  32.81 
 
 		 373 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  23.76 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 		 371 aa  47  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1058  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  25.1 
 
 		 445 aa  47  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00865226  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 381 aa  46.6  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  25.42 
 
 		 382 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  24.83 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  23.51 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  26.16 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  25.98 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1059  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  22.46 
 
 		 457 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.163235  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  27.36 
 
 		 380 aa  44.3  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  22.62 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  27.62 
 
 		 374 aa  43.9  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  21.45 
 
 		 368 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  23.78 
 
 		 365 aa  43.9  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 		 378 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>