88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2712 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2712  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  100 
 
 		 413 aa  798    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30220  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  49.03 
 
 		 407 aa  330  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.861624  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0108  putative ABC transporter  43 
 
 		 438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.850247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0532  ABC-type Na+ efflux pump permease component  42.61 
 
 		 413 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00136958  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2601  putative ABC transporter permease  47 
 
 		 412 aa  264  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.242329 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1946  ABC-2 type transporter  38.46 
 
 		 400 aa  262  6.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1273  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  35.75 
 
 		 410 aa  190  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0836  ABC transporter permease  36.01 
 
 		 395 aa  166  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0731  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  32.23 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0582  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  30.81 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0905  Na+ efflux pump ABC transporter permease-like protein  34.01 
 
 		 366 aa  142  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.17496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4173  putative ABC transporter  32.17 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1116  Na+ efflux pump ABC transporter permease-like protein  41.46 
 
 		 358 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.139132 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0859  putative Na+ efflux ABC transporter, permease component  31.67 
 
 		 368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00918968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6163  ABC transporter permease  33.33 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0635  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  27.47 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000153887  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2404  hypothetical protein  35.37 
 
 		 429 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.398451  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7296  hypothetical protein  27.42 
 
 		 437 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1451  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  28.64 
 
 		 409 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1178  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  26.2 
 
 		 426 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0911263  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3030  putative Na+ efflux ABC transporter, permease component  32.54 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.509957  hitchhiker  0.000114076 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4513  hypothetical protein  25.99 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.2961  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08266  ABC transporter, permease protein, putative  23.5 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26820  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  30.96 
 
 		 379 aa  111  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749324  normal  0.452605 
 
 
-
 
NC_002950  PG0945  ABC transporter, permease protein, putative  25.57 
 
 		 442 aa  109  9.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0199205 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1384  putative ABC transporter permease  29.67 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.378059  normal  0.872307 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0486  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.06 
 
 		 419 aa  107  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2743  ABC-type Na+ efflux pump permease component  30.61 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306664  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2039  ABC-2 type transporter  23.8 
 
 		 424 aa  104  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4966  ABC transporter, permease protein, putative  24.44 
 
 		 439 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4635  hypothetical protein  27.44 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0704  hypothetical protein  26.88 
 
 		 403 aa  99.8  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0852  sodium extrusion protein NatB, putative  25.37 
 
 		 416 aa  98.6  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.5876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4256  hypothetical protein  27.63 
 
 		 406 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.199751  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4621  hypothetical protein  27.63 
 
 		 406 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4404  hypothetical protein  27.63 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_756  ABC transporter, permease protein  29.51 
 
 		 405 aa  97.8  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0135656  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4744  hypothetical protein  27.63 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0699  hypothetical protein  26.09 
 
 		 403 aa  96.3  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.513014  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5048  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  24.19 
 
 		 438 aa  96.3  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.626469  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1794  hypothetical protein  29.92 
 
 		 353 aa  94.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3327  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  29.39 
 
 		 411 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.63317  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0771  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  27.76 
 
 		 405 aa  94.4  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1780  hypothetical protein  29.62 
 
 		 353 aa  93.6  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2365  hypothetical protein  24.16 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2410  hypothetical protein  24.16 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0745502  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2673  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.42 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.270062  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3209  sodium export permease protein  22.52 
 
 		 408 aa  88.2  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1740  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  24.15 
 
 		 441 aa  86.3  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1046  hypothetical protein  27.44 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.75067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4022  ABC transporter, permease component, putative sodium exporter  24.94 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2425  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  25.73 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5257  hypothetical protein  27.51 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0618  sodium export permease protein  25.85 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4637  sodium export permease protein  26.2 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4244  hypothetical protein  26.2 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.256998  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4337  ABC-2 type transport system permease protein  26.43 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4617  sodium export permease protein  26.52 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1452  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.6 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.75331  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0228  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  26.67 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0360  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  20.66 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1730  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  24.05 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000352957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2674  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  31.36 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402271  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1059  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  29.53 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.163235  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3999  ATP-dependent Na+ efflux pump  24.44 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.241363 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1058  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  26.95 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00865226  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1945  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  24.68 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.645504  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33500  hypothetical protein  27.05 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.178585  normal  0.421552 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3474  ATP-dependent Na+ efflux pump  22.25 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2558  hypothetical protein  27.61 
 
 		 466 aa  56.2  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.246034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0143  hypothetical protein  25.9 
 
 		 359 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467996  decreased coverage  0.00277637 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1533  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  31.08 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1807  ATP-dependent Na+ efflux pump  23.94 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000010693 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  29.56 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 384 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 		 373 aa  46.6  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  28.85 
 
 		 373 aa  46.6  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 373 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 384 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  31.76 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 373 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  31.76 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  31.76 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 373 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  31.76 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  25.56 
 
 		 367 aa  43.5  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  26.18 
 
 		 390 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>