64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0228 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0228  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  100 
 
 		 393 aa  774    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1730  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  27.65 
 
 		 411 aa  156  6e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000352957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0360  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  21.09 
 
 		 406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4022  ABC transporter, permease component, putative sodium exporter  25.12 
 
 		 413 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0635  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  23.46 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000153887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4635  hypothetical protein  25.27 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4256  hypothetical protein  24.2 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.199751  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1451  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  25.12 
 
 		 409 aa  97.1  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4404  hypothetical protein  23.94 
 
 		 406 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4744  hypothetical protein  23.94 
 
 		 406 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3209  sodium export permease protein  24.65 
 
 		 408 aa  96.3  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2410  hypothetical protein  23.76 
 
 		 410 aa  96.3  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0745502  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2365  hypothetical protein  23.76 
 
 		 410 aa  96.3  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4621  hypothetical protein  23.94 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1945  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  21.81 
 
 		 453 aa  92.4  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.645504  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0618  sodium export permease protein  24.23 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0108  putative ABC transporter  24 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.850247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0699  hypothetical protein  24.24 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.513014  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0704  hypothetical protein  24.38 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4617  sodium export permease protein  23.66 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0731  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  24.29 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1533  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.41 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4513  hypothetical protein  23.35 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.2961  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4337  ABC-2 type transport system permease protein  24.52 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4244  hypothetical protein  24.86 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.256998  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4637  sodium export permease protein  24.86 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1946  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1058  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  22.97 
 
 		 445 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00865226  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0859  putative Na+ efflux ABC transporter, permease component  24.14 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00918968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4173  putative ABC transporter  26.67 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1059  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  26.44 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.163235  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0945  ABC transporter, permease protein, putative  23.63 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0199205 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30220  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  22.19 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.861624  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1178  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  23.1 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0911263  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2404  hypothetical protein  25.3 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.398451  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2039  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3030  putative Na+ efflux ABC transporter, permease component  26.92 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.509957  hitchhiker  0.000114076 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1273  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  21.48 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26820  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749324  normal  0.452605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0836  ABC transporter permease  28.8 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2601  putative ABC transporter permease  23.16 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.242329 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2743  ABC-type Na+ efflux pump permease component  26.24 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306664  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0486  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  26.32 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1794  hypothetical protein  24.76 
 
 		 353 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1046  hypothetical protein  21.64 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.75067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5257  hypothetical protein  26.88 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0771  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  24.5 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1116  Na+ efflux pump ABC transporter permease-like protein  22.43 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.139132 
 
 
-
 
NC_002936  DET0852  sodium extrusion protein NatB, putative  24.12 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.5876  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1780  hypothetical protein  24.84 
 
 		 353 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1384  putative ABC transporter permease  25.94 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.378059  normal  0.872307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0582  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  22.79 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_756  ABC transporter, permease protein  23.46 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0135656  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5048  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  23.52 
 
 		 438 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.626469  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0905  Na+ efflux pump ABC transporter permease-like protein  22.51 
 
 		 366 aa  53.5  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.17496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0532  ABC-type Na+ efflux pump permease component  25.58 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00136958  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4966  ABC transporter, permease protein, putative  24.92 
 
 		 439 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2712  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  25 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2673  putative ABC-2 type transport system permease protein  21.38 
 
 		 412 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.270062  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08266  ABC transporter, permease protein, putative  23.35 
 
 		 433 aa  50.1  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6163  ABC transporter permease  20.64 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2558  hypothetical protein  22.09 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.246034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3474  ATP-dependent Na+ efflux pump  18.62 
 
 		 430 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1452  putative ABC-2 type transport system permease protein  23.81 
 
 		 411 aa  47.4  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.75331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>