82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1452 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1452  putative ABC-2 type transport system permease protein  100 
 
 
411 aa  809    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.75331  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1046  hypothetical protein  29.44 
 
 
429 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.75067  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0852  sodium extrusion protein NatB, putative  26.81 
 
 
416 aa  157  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.5876  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_756  ABC transporter, permease protein  27.12 
 
 
405 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0135656  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3999  ATP-dependent Na+ efflux pump  26.18 
 
 
406 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.241363 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0771  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  26.39 
 
 
405 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3327  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  23.11 
 
 
411 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.63317  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2673  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.25 
 
 
412 aa  136  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.270062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2404  hypothetical protein  24.72 
 
 
429 aa  120  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.398451  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5048  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  25.34 
 
 
438 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.626469  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4513  hypothetical protein  23.93 
 
 
432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.2961  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3474  ATP-dependent Na+ efflux pump  22.17 
 
 
430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0945  ABC transporter, permease protein, putative  22.17 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0199205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1807  ATP-dependent Na+ efflux pump  23.1 
 
 
432 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000010693 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0635  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  23.21 
 
 
412 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000153887  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1740  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  23.7 
 
 
441 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08266  ABC transporter, permease protein, putative  24.09 
 
 
433 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2425  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  21.87 
 
 
400 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741043  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4966  ABC transporter, permease protein, putative  21.67 
 
 
439 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7296  hypothetical protein  22.87 
 
 
437 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0731  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  22.34 
 
 
390 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30220  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  22.22 
 
 
407 aa  97.1  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.861624  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1946  ABC-2 type transporter  21.32 
 
 
400 aa  96.3  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0532  ABC-type Na+ efflux pump permease component  22.25 
 
 
413 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00136958  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2039  ABC-2 type transporter  22.58 
 
 
424 aa  95.5  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1451  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  23.53 
 
 
409 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0699  hypothetical protein  25.2 
 
 
403 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.513014  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0704  hypothetical protein  25.2 
 
 
403 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1116  Na+ efflux pump ABC transporter permease-like protein  27.32 
 
 
358 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.139132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0108  putative ABC transporter  22.31 
 
 
438 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.850247  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4022  ABC transporter, permease component, putative sodium exporter  25.29 
 
 
413 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0905  Na+ efflux pump ABC transporter permease-like protein  22.97 
 
 
366 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.17496  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2558  hypothetical protein  27.17 
 
 
466 aa  88.6  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.246034  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2674  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  24.48 
 
 
428 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402271  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1178  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  25.61 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0911263  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2601  putative ABC transporter permease  21.95 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.242329 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0486  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  19.21 
 
 
419 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1273  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  21.11 
 
 
410 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2712  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  24.27 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0859  putative Na+ efflux ABC transporter, permease component  21.49 
 
 
368 aa  76.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00918968  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1945  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  26.94 
 
 
453 aa  74.7  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.645504  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1730  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  20.15 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000352957  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2743  ABC-type Na+ efflux pump permease component  25.83 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306664  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0836  ABC transporter permease  21.32 
 
 
395 aa  67  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6163  ABC transporter permease  24.12 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19888  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26820  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.89 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749324  normal  0.452605 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0360  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  24.27 
 
 
406 aa  66.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3209  sodium export permease protein  22.67 
 
 
408 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5257  hypothetical protein  23.49 
 
 
406 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4635  hypothetical protein  23.69 
 
 
406 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0228  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  23.75 
 
 
393 aa  60.8  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0219  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  22.63 
 
 
414 aa  60.5  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.444112  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1794  hypothetical protein  20 
 
 
353 aa  59.7  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37432  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3030  putative Na+ efflux ABC transporter, permease component  26.82 
 
 
377 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.509957  hitchhiker  0.000114076 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4621  hypothetical protein  22.7 
 
 
406 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1780  hypothetical protein  27.65 
 
 
353 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4256  hypothetical protein  22.7 
 
 
406 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.199751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4404  hypothetical protein  22.15 
 
 
406 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4744  hypothetical protein  22.15 
 
 
406 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0582  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  25.26 
 
 
387 aa  56.6  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0618  sodium export permease protein  23.51 
 
 
408 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4617  sodium export permease protein  23.51 
 
 
408 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2365  hypothetical protein  21.05 
 
 
410 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2410  hypothetical protein  21.05 
 
 
410 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0745502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1059  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  21.25 
 
 
457 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.163235  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4173  putative ABC transporter  25.73 
 
 
390 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4337  ABC-2 type transport system permease protein  21.43 
 
 
407 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4637  sodium export permease protein  22.45 
 
 
407 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4244  hypothetical protein  22.45 
 
 
407 aa  53.5  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.256998  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1384  putative ABC transporter permease  18.81 
 
 
405 aa  53.1  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.378059  normal  0.872307 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  25.31 
 
 
394 aa  53.1  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2866  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  18.8 
 
 
414 aa  52.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.650655 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  24.69 
 
 
394 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1533  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  21.24 
 
 
414 aa  47.8  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  22.78 
 
 
405 aa  47  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  26.22 
 
 
381 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  24.37 
 
 
378 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  22.68 
 
 
365 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  22.41 
 
 
382 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4575  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.05 
 
 
370 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_002936  DET0114  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  22.8 
 
 
357 aa  43.1  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  23.69 
 
 
364 aa  43.1  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>