31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0114 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0114  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  100 
 
 		 357 aa  706    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_123  ABC transporter, type 2, substrate-binding protein  97.48 
 
 		 357 aa  674    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0255  ABC-2 type transporter  92.72 
 
 		 357 aa  665    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0520  ABC-2 type transporter  42.94 
 
 		 349 aa  276  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0521  ABC-2 type transporter  23.72 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0254  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 352 aa  72.8  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_124  ABC transporter, type 2, permease protein  26.88 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0115  ABC transporter, permease protein, putative  25.7 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2671  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000231405  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0601  putative ABC-2 type transport system permease protein  20 
 
 		 347 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4575  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  21.8 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03700  ABC-2 type transporter  22.84 
 
 		 333 aa  53.1  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3830  hypothetical protein  30.67 
 
 		 246 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.346144  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  21.92 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  26.48 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  24.66 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  24.31 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  23.08 
 
 		 339 aa  46.6  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  21.75 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  24.01 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.88 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  25.91 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  26.18 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  19.38 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1452  putative ABC-2 type transport system permease protein  22.8 
 
 		 411 aa  43.5  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.75331  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  22.27 
 
 		 399 aa  43.1  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3802  ABC-2 type transporter  24.83 
 
 		 235 aa  42.7  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.589167  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03710  ABC-2 type transporter  22.29 
 
 		 348 aa  43.1  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 		 371 aa  42.7  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  25.86 
 
 		 339 aa  42.7  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  20.11 
 
 		 381 aa  42.7  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>