21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_03710 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_03710  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 348 aa  692    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03700  ABC-2 type transporter  22.71 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_124  ABC transporter, type 2, permease protein  22.37 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0115  ABC transporter, permease protein, putative  21.71 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0254  ABC-2 type transporter  21.66 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0521  ABC-2 type transporter  23.3 
 
 		 352 aa  53.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2203  putative antibiotic-transport integral membrane leucine and valine rich protein ABC transporter  23.97 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189987  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2249  putative antibiotic-transport integral membrane leucine and valine rich protein ABC transporter  23.97 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2192  putative antibiotic-transport integral membrane leucine and valine rich protein ABC transporter  23.97 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464574  normal  0.0472019 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  31.97 
 
 		 942 aa  46.6  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  26.9 
 
 		 1082 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  26.9 
 
 		 1071 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  26.9 
 
 		 1089 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  26.9 
 
 		 1066 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  26.9 
 
 		 1079 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  27.78 
 
 		 930 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  26.9 
 
 		 1071 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  26.06 
 
 		 379 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0114  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  22.29 
 
 		 357 aa  43.1  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  25.19 
 
 		 917 aa  42.7  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2002  ABC-2 type transporter  27.19 
 
 		 234 aa  42.7  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>