25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0255 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0114  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  92.72 
 
 		 357 aa  665    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_123  ABC transporter, type 2, substrate-binding protein  92.44 
 
 		 357 aa  648    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0255  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 357 aa  706    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0520  ABC-2 type transporter  42.94 
 
 		 349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0254  ABC-2 type transporter  27.21 
 
 		 352 aa  72.8  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0521  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_124  ABC transporter, type 2, permease protein  26.92 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0115  ABC transporter, permease protein, putative  26.84 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2671  ABC-2 type transporter  25.16 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000231405  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03700  ABC-2 type transporter  21.31 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3830  hypothetical protein  32.68 
 
 		 246 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.346144  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4575  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  21.8 
 
 		 370 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0601  putative ABC-2 type transport system permease protein  19.15 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  22.16 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  23.77 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  26.42 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0972  hypothetical protein  32.26 
 
 		 246 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.484216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  19.82 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  22.41 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3802  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 		 235 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.589167  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  22.95 
 
 		 373 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  23.35 
 
 		 371 aa  43.9  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  31.48 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  28.1 
 
 		 1106 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>