94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0520 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0520  ABC-2 type transporter  100 
 
 
349 aa  676    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0114  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  42.94 
 
 
357 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0255  ABC-2 type transporter  42.94 
 
 
357 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_123  ABC transporter, type 2, substrate-binding protein  42.65 
 
 
357 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0254  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 
352 aa  99.4  8e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_124  ABC transporter, type 2, permease protein  25.36 
 
 
352 aa  99  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0115  ABC transporter, permease protein, putative  25.36 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0521  ABC-2 type transporter  31.84 
 
 
352 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203171  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  25.98 
 
 
373 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2671  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 
372 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000231405  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  24.47 
 
 
380 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  29.87 
 
 
284 aa  60.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  24.16 
 
 
365 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 
288 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  23.87 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9218  ABC transporter  23.75 
 
 
374 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  24.27 
 
 
378 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  23.04 
 
 
367 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0601  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.74 
 
 
347 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  24.91 
 
 
370 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  24.09 
 
 
376 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 
372 aa  50.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  24.88 
 
 
901 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  24.88 
 
 
901 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  23.4 
 
 
365 aa  50.1  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  25.45 
 
 
374 aa  49.7  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  25 
 
 
399 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.1 
 
 
271 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3802  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 
235 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.589167  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0017  ABC transporter, permease protein  27.72 
 
 
376 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  24.37 
 
 
381 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  26.98 
 
 
921 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 
379 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 
260 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  29.81 
 
 
255 aa  47.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  23.26 
 
 
365 aa  47.4  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  24.7 
 
 
256 aa  47  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  24.55 
 
 
916 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  25.84 
 
 
928 aa  46.6  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  26.9 
 
 
369 aa  46.2  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1040  ABC transporter, permease  30.43 
 
 
374 aa  46.2  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  29.75 
 
 
368 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.28 
 
 
907 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0437  ABC transporter, permease  30.43 
 
 
374 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1451  hypothetical protein  25.56 
 
 
258 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.245884  normal  0.0167299 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 
368 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  29.75 
 
 
368 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0138  ABC transporter, permease  30.43 
 
 
374 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  29.75 
 
 
368 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  29.75 
 
 
368 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1308  ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 
374 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2777  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.43 
 
 
374 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2634  ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 
374 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0164  ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 
374 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0920361  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  25.27 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  24.7 
 
 
256 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  29.75 
 
 
368 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  29.75 
 
 
368 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  29.75 
 
 
368 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 
368 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  31.43 
 
 
362 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  29.82 
 
 
368 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  22.17 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 
258 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  29.82 
 
 
368 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  24.76 
 
 
368 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  26.71 
 
 
913 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  29.82 
 
 
368 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  26.71 
 
 
913 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  29.82 
 
 
368 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  26.71 
 
 
913 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  29.94 
 
 
285 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  28.48 
 
 
243 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  28.48 
 
 
243 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  23.27 
 
 
371 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  22.56 
 
 
387 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3830  hypothetical protein  28.22 
 
 
246 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.346144  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  23.49 
 
 
256 aa  43.9  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 
256 aa  43.9  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  26.11 
 
 
376 aa  43.5  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  25.31 
 
 
281 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  22.26 
 
 
901 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  23.31 
 
 
370 aa  43.5  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1131  ABC-2 type transporter  25.56 
 
 
390 aa  43.1  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.315475  hitchhiker  0.00237195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4575  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.06 
 
 
370 aa  43.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3447  ABC-2 type transporter  29.14 
 
 
376 aa  43.1  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0565648  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  26.09 
 
 
913 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  26.1 
 
 
376 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  26.1 
 
 
376 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  26.1 
 
 
376 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  26.1 
 
 
376 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  22.84 
 
 
930 aa  42.7  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>