34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_123 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0114  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  97.48 
 
 		 357 aa  694    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_123  ABC transporter, type 2, substrate-binding protein  100 
 
 		 357 aa  707    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0255  ABC-2 type transporter  92.44 
 
 		 357 aa  667    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0520  ABC-2 type transporter  42.65 
 
 		 349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0521  ABC-2 type transporter  23.64 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0254  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 352 aa  72.8  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_124  ABC transporter, type 2, permease protein  26.39 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0115  ABC transporter, permease protein, putative  25.91 
 
 		 352 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2671  ABC-2 type transporter  25.24 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000231405  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03700  ABC-2 type transporter  22.32 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0601  putative ABC-2 type transport system permease protein  19.71 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4575  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  21.74 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3830  hypothetical protein  30 
 
 		 246 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.346144  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  22.07 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  23.56 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  24.22 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.22 
 
 		 356 aa  46.2  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  22.1 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  25.87 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  25.91 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  20.27 
 
 		 381 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  22.74 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  22.6 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  21.21 
 
 		 382 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  21.37 
 
 		 373 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  21.37 
 
 		 373 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  21.37 
 
 		 373 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  21.37 
 
 		 373 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2203  putative antibiotic-transport integral membrane leucine and valine rich protein ABC transporter  29.35 
 
 		 235 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03710  ABC-2 type transporter  21.69 
 
 		 348 aa  42.7  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2249  putative antibiotic-transport integral membrane leucine and valine rich protein ABC transporter  29.35 
 
 		 235 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2192  putative antibiotic-transport integral membrane leucine and valine rich protein ABC transporter  29.35 
 
 		 235 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464574  normal  0.0472019 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  23.48 
 
 		 366 aa  42.7  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3802  ABC-2 type transporter  24.14 
 
 		 235 aa  42.7  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.589167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>