72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0859 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0859  putative Na+ efflux ABC transporter, permease component  100 
 
 
368 aa  704    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00918968  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3030  putative Na+ efflux ABC transporter, permease component  62.32 
 
 
377 aa  358  8e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.509957  hitchhiker  0.000114076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2743  ABC-type Na+ efflux pump permease component  44.69 
 
 
360 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306664  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1794  hypothetical protein  47.29 
 
 
353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37432  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1780  hypothetical protein  47.01 
 
 
353 aa  242  6e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26820  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  43.3 
 
 
379 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749324  normal  0.452605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4173  putative ABC transporter  37.44 
 
 
390 aa  197  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0108  putative ABC transporter  33.17 
 
 
438 aa  149  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.850247  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1384  putative ABC transporter permease  33.07 
 
 
405 aa  147  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.378059  normal  0.872307 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30220  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  33.42 
 
 
407 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.861624  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1273  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  31.3 
 
 
410 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2601  putative ABC transporter permease  31.58 
 
 
412 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.242329 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1946  ABC-2 type transporter  30.52 
 
 
400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0731  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  31.36 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0532  ABC-type Na+ efflux pump permease component  33.5 
 
 
413 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00136958  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1451  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  31.89 
 
 
409 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2712  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  30.71 
 
 
413 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6163  ABC transporter permease  34.81 
 
 
371 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19888  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0635  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  28.12 
 
 
412 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000153887  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1116  Na+ efflux pump ABC transporter permease-like protein  32.98 
 
 
358 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.139132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0836  ABC transporter permease  33.5 
 
 
395 aa  102  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4635  hypothetical protein  26.75 
 
 
406 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2404  hypothetical protein  26.3 
 
 
429 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.398451  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0905  Na+ efflux pump ABC transporter permease-like protein  31.55 
 
 
366 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.17496  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4513  hypothetical protein  26.69 
 
 
432 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.2961  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4744  hypothetical protein  25.84 
 
 
406 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4256  hypothetical protein  25.84 
 
 
406 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.199751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4404  hypothetical protein  25.84 
 
 
406 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4617  sodium export permease protein  29.84 
 
 
408 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0618  sodium export permease protein  29.84 
 
 
408 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4022  ABC transporter, permease component, putative sodium exporter  24.17 
 
 
413 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0699  hypothetical protein  27.95 
 
 
403 aa  93.6  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.513014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4621  hypothetical protein  25.58 
 
 
406 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1730  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.54 
 
 
411 aa  92.8  9e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000352957  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0852  sodium extrusion protein NatB, putative  22.69 
 
 
416 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.5876  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2039  ABC-2 type transporter  23.32 
 
 
424 aa  91.3  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0704  hypothetical protein  27.51 
 
 
403 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_756  ABC transporter, permease protein  23.44 
 
 
405 aa  89  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0135656  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0945  ABC transporter, permease protein, putative  23.91 
 
 
442 aa  87.4  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0199205 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3209  sodium export permease protein  23 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1178  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  21.74 
 
 
426 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0911263  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0771  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  22.25 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0582  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  36.24 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3327  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  25.99 
 
 
411 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.63317  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0228  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  24.14 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0486  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.5 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08266  ABC transporter, permease protein, putative  23.54 
 
 
433 aa  78.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4244  hypothetical protein  26.42 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.256998  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4637  sodium export permease protein  26.42 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4337  ABC-2 type transport system permease protein  28.87 
 
 
407 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2425  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  25.89 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741043  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4966  ABC transporter, permease protein, putative  24.2 
 
 
439 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7296  hypothetical protein  23.19 
 
 
437 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2410  hypothetical protein  26.61 
 
 
410 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0745502  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2365  hypothetical protein  26.61 
 
 
410 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5257  hypothetical protein  27.44 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5048  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  22.45 
 
 
438 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.626469  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1046  hypothetical protein  22.84 
 
 
429 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.75067  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1740  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  23.86 
 
 
441 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1059  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  26.14 
 
 
457 aa  63.2  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.163235  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2673  putative ABC-2 type transport system permease protein  21.75 
 
 
412 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.270062  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1452  putative ABC-2 type transport system permease protein  20.74 
 
 
411 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.75331  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1533  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.19 
 
 
414 aa  60.8  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3999  ATP-dependent Na+ efflux pump  23.68 
 
 
406 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.241363 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2558  hypothetical protein  29.09 
 
 
466 aa  59.7  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.246034  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1058  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  24.2 
 
 
445 aa  56.6  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00865226  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0360  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  27.5 
 
 
406 aa  56.2  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0219  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  26.02 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.444112  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2674  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  28.64 
 
 
428 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402271  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3474  ATP-dependent Na+ efflux pump  23.67 
 
 
430 aa  49.7  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1945  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.11 
 
 
453 aa  47.4  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.645504  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2866  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  25.78 
 
 
414 aa  47  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.650655 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>