43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1565 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1565  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 433 aa  841    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000580039  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0394  ABC-2 type transporter  31.5 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1421  ABC-2 type transporter  29.19 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1173  ABC-2 type transporter  23.54 
 
 		 437 aa  97.4  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0213  putative ABC-2 type transport system permease protein  23.74 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.331802  normal  0.747646 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1131  ABC-2 type transporter  29.93 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.315475  hitchhiker  0.00237195 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1178  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  26.6 
 
 		 426 aa  54.3  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0911263  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1676  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 413 aa  53.9  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1321  ABC-2 type transporter  21.34 
 
 		 365 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.800168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  22.01 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3777  ABC transporter ATP-binding protein  23.68 
 
 		 374 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.439357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3787  ABC transporter, ATP-binding protein  22.88 
 
 		 374 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3957  ABC transporter ATP-binding protein  23.25 
 
 		 374 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3327  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  21.78 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.63317  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3897  ABC transporter ATP-binding protein  22.88 
 
 		 374 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3854  ABC transporter ATP-binding protein  22.88 
 
 		 374 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  23.42 
 
 		 394 aa  49.7  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0852  sodium extrusion protein NatB, putative  22.46 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.5876  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0704  hypothetical protein  28.33 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_756  ABC transporter, permease protein  21.94 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0135656  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3735  heavy metal efflux pump CzcA  29.44 
 
 		 392 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2558  hypothetical protein  25.86 
 
 		 466 aa  47.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.246034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0699  hypothetical protein  28.33 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.513014  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0112  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  25.68 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0143  hypothetical protein  30.21 
 
 		 359 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467996  decreased coverage  0.00277637 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03287  hypothetical protein  22.01 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4830  ABC transporter, ATP-binding protein  22.01 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0230  ABC-2 type transporter  22.01 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3837  ABC transporter, ATP-binding protein  22.01 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3774  ABC transporter, ATP-binding protein  22.01 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03335  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  22.01 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3967  ABC transporter, ATP-binding protein  22.01 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3684  ABC transporter, ATP-binding protein  22.01 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0771  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  22.26 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0229  ABC-2 type transporter  22.01 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  24.72 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0988  hypothetical protein  22.43 
 
 		 374 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  21.4 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  24.4 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2943  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 405 aa  44.3  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0209  conserved hypothetical protein  26.07 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4617  sodium export permease protein  25.11 
 
 		 408 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0618  sodium export permease protein  25.11 
 
 		 408 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>