37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0354 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0354  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  518  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4578  putative ABC transporter, permease component  33.83 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000593867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5525  hypothetical protein  37.61 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7393  hypothetical protein  34.35 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1443  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.36 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151411  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0090  ABC-2 type transporter  31.37 
 
 		 273 aa  89  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2772  putative ABC transporter, permease protein  32.82 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000273576 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2157  hypothetical protein  24.33 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1721  hypothetical protein  24.72 
 
 		 263 aa  72  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1779  ABC transporter, permease protein, putative  24.91 
 
 		 263 aa  72  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120662  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2158  putative ABC-2 type transport system permease protein  28.57 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.82128  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1243  hypothetical protein  26.6 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1773  hypothetical protein  25 
 
 		 546 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2170  ABC transporter, permease component  27.46 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3701  ABC transporter, permease protein  20.46 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000237165  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0455  hypothetical protein  25.55 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3299  ABC transporter, permease  20.23 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380942  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0021  CesD  19.84 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1616  ABC transporter, permease protein  19.92 
 
 		 268 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000619745  hitchhiker  0.000000421446 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3609  ABC transporter, permease protein  20.08 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000116329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3603  ABC transporter, permease protein  19.85 
 
 		 268 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6354299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1837  hypothetical protein  30.15 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4246  hypothetical protein  32.56 
 
 		 266 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3350  ABC transporter, permease  19.47 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.97912e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1185  hypothetical protein  27.01 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0190  hypothetical protein  19.7 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1131  ABC-2 type transporter  32.43 
 
 		 390 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.315475  hitchhiker  0.00237195 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1838  hypothetical protein  25.32 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3278  ABC transporter, permease component  19.31 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00162462  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  32.59 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  33.6 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0041  ABC-2 type transporter  32.69 
 
 		 259 aa  43.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  37.04 
 
 		 305 aa  42.7  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  28.35 
 
 		 279 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  30.67 
 
 		 405 aa  42.4  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  29.07 
 
 		 271 aa  42.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1244  hypothetical protein  24.58 
 
 		 260 aa  42  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>