22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2158 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2158  putative ABC-2 type transport system permease protein  100 
 
 		 266 aa  527  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.82128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1443  ABC-type multidrug transport system, permease component  35.88 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151411  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2157  hypothetical protein  30.6 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1779  ABC transporter, permease protein, putative  29.21 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120662  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1721  hypothetical protein  27.55 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0190  hypothetical protein  25.47 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1243  hypothetical protein  27.57 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1244  hypothetical protein  27.52 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0354  hypothetical protein  28.57 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0456  hypothetical protein  25.57 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7393  hypothetical protein  23.68 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0090  ABC-2 type transporter  25.45 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4578  putative ABC transporter, permease component  22.14 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000593867  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0455  hypothetical protein  24.29 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1837  hypothetical protein  23.46 
 
 		 277 aa  53.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1185  hypothetical protein  23.22 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2984  hypothetical protein  25.39 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0021  CesD  20.88 
 
 		 268 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4246  hypothetical protein  23.42 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0427  hypothetical protein  24.72 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1989  hypothetical protein  23.03 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000959722  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0757  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  26.44 
 
 		 367 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.329379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>