22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0190 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0190  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  528  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1721  hypothetical protein  34.46 
 
 
263 aa  161  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1779  ABC transporter, permease protein, putative  34.08 
 
 
263 aa  155  6e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1443  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.66 
 
 
265 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151411  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2158  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.47 
 
 
266 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.82128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2157  hypothetical protein  24.81 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0455  hypothetical protein  27.55 
 
 
265 aa  89.4  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0456  hypothetical protein  24.15 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1185  hypothetical protein  23.7 
 
 
268 aa  61.2  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1244  hypothetical protein  22.32 
 
 
260 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2170  ABC transporter, permease component  20.5 
 
 
268 aa  49.3  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1635  hypothetical protein  23.31 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00020049  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3350  ABC transporter, permease  21.76 
 
 
268 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.97912e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1837  hypothetical protein  19.67 
 
 
277 aa  47  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3603  ABC transporter, permease protein  21.76 
 
 
268 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6354299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3701  ABC transporter, permease protein  22.01 
 
 
268 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000237165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0354  hypothetical protein  19.7 
 
 
266 aa  46.2  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3299  ABC transporter, permease  21.34 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380942  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0079  hypothetical protein  22.59 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1243  hypothetical protein  21.03 
 
 
285 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3609  ABC transporter, permease protein  22.01 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000116329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1616  ABC transporter, permease protein  21.15 
 
 
268 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000619745  hitchhiker  0.000000421446 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>