22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0079 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0079  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  517  1e-146  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1635  hypothetical protein  41.89 
 
 
266 aa  229  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00020049  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3350  ABC transporter, permease  30.26 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.97912e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3603  ABC transporter, permease protein  30.26 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6354299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3299  ABC transporter, permease  29.89 
 
 
268 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380942  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3701  ABC transporter, permease protein  29.37 
 
 
268 aa  115  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000237165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1616  ABC transporter, permease protein  29 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000619745  hitchhiker  0.000000421446 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3609  ABC transporter, permease protein  29.96 
 
 
259 aa  112  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000116329  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3278  ABC transporter, permease component  28.68 
 
 
268 aa  108  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00162462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3386  hypothetical protein  30.95 
 
 
208 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0545233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1989  hypothetical protein  26.77 
 
 
261 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000959722  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3617  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
163 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0021  CesD  22.22 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4578  putative ABC transporter, permease component  25.53 
 
 
270 aa  55.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000593867  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1243  hypothetical protein  26.14 
 
 
285 aa  52.4  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1443  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.18 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151411  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0656  ABC transporter permease  24.34 
 
 
254 aa  49.3  0.00006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.434331  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0190  hypothetical protein  22.59 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4246  hypothetical protein  26.34 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3619  ABC transporter, permease  26.36 
 
 
118 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115801  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1244  hypothetical protein  25.98 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2170  ABC transporter, permease component  23.19 
 
 
268 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>