33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1779 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1779  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 263 aa  520  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120662  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1721  hypothetical protein  94.68 
 
 		 263 aa  497  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0190  hypothetical protein  34.08 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1443  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.09 
 
 		 265 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151411  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2158  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.21 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.82128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2157  hypothetical protein  29.65 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4578  putative ABC transporter, permease component  24.44 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000593867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0354  hypothetical protein  24.91 
 
 		 266 aa  72  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0455  hypothetical protein  23.88 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1185  hypothetical protein  22.26 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3299  ABC transporter, permease  23.22 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3609  ABC transporter, permease protein  23.75 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000116329  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0456  hypothetical protein  25.75 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3603  ABC transporter, permease protein  23.22 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6354299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3350  ABC transporter, permease  23.22 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.97912e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0021  CesD  23.66 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3701  ABC transporter, permease protein  23.31 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000237165  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7393  hypothetical protein  22.3 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1616  ABC transporter, permease protein  22.88 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000619745  hitchhiker  0.000000421446 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1243  hypothetical protein  26.41 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1244  hypothetical protein  25.7 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3278  ABC transporter, permease component  22.46 
 
 		 268 aa  52.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00162462  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2984  hypothetical protein  24.16 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1635  hypothetical protein  23.31 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00020049  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4246  hypothetical protein  24.58 
 
 		 266 aa  49.3  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  28.67 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3386  hypothetical protein  22.17 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0545233  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  25.76 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0090  ABC-2 type transporter  23.04 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2059  hypothetical protein  28.74 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0210  hypothetical protein  35.71 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5525  hypothetical protein  24.58 
 
 		 262 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  27.4 
 
 		 240 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11106 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>