34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0210 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0210  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  504  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0041  ABC-2 type transporter  70.2 
 
 
259 aa  360  1e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4688  hypothetical protein  55.64 
 
 
257 aa  262  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583661  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1587  hypothetical protein  53.31 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1612  putative efflux ABC transporter, permease protein PilI  53.31 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5300  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  51.36 
 
 
257 aa  249  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3793  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  49.42 
 
 
257 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0299  hypothetical protein  32.31 
 
 
263 aa  115  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2674  hypothetical protein  30.57 
 
 
270 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1572  hypothetical protein  29.3 
 
 
258 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216442  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0633  hypothetical protein  30.52 
 
 
253 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0667  hypothetical protein  30.99 
 
 
252 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1401  hypothetical protein  31.08 
 
 
271 aa  94.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.441755 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0667  hypothetical protein  29.11 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1499  hypothetical protein  27.45 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2141  ABC-type transport system, putative ATPase subunit  28.57 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00431135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2588  hypothetical protein  27.17 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2091  hypothetical protein  28.71 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.487971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1659  hypothetical protein  29.7 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104222  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0058  putative membrane bound transporter  21.35 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0678  hypothetical protein  29.95 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.661689  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1638  hypothetical protein  25.62 
 
 
264 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0462  hypothetical protein  24.3 
 
 
280 aa  59.3  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1808  hypothetical protein  25.96 
 
 
277 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.877505  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  31.78 
 
 
278 aa  49.7  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0790  hypothetical protein  25.1 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0382  hypothetical protein  24.44 
 
 
290 aa  46.6  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.482052  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0961  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  25.46 
 
 
292 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169309  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1779  ABC transporter, permease protein, putative  35.71 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120662  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0086  ABC-2 type transporter  38.81 
 
 
322 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  34.78 
 
 
274 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 
278 aa  43.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0017  ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 
376 aa  42.7  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1721  hypothetical protein  33.7 
 
 
263 aa  42.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>