22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2091 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2091  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  512  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.487971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2588  hypothetical protein  75 
 
 
264 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1638  hypothetical protein  75.76 
 
 
264 aa  359  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1659  hypothetical protein  64.39 
 
 
263 aa  295  5e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104222  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1499  hypothetical protein  51.52 
 
 
263 aa  268  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1401  hypothetical protein  48.85 
 
 
271 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.441755 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2674  hypothetical protein  30.4 
 
 
270 aa  98.6  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2141  ABC-type transport system, putative ATPase subunit  30.42 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00431135  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0210  hypothetical protein  29.02 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1572  hypothetical protein  26.56 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216442  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0667  hypothetical protein  28.41 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0041  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4688  hypothetical protein  26.09 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583661  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3793  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  26.09 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0633  hypothetical protein  26.34 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0667  hypothetical protein  27.27 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0299  hypothetical protein  27.2 
 
 
263 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1587  hypothetical protein  26.17 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1612  putative efflux ABC transporter, permease protein PilI  26.17 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5300  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  23.74 
 
 
257 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0678  hypothetical protein  26.42 
 
 
252 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.661689  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1808  hypothetical protein  32.43 
 
 
277 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.877505  normal  0.782287 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>