31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0299 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0299  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  511  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1572  hypothetical protein  35.09 
 
 
258 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216442  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3793  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  34.6 
 
 
257 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0041  ABC-2 type transporter  30.37 
 
 
259 aa  123  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1612  putative efflux ABC transporter, permease protein PilI  32.46 
 
 
257 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1587  hypothetical protein  32.46 
 
 
257 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0210  hypothetical protein  32.31 
 
 
257 aa  115  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4688  hypothetical protein  30.22 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583661  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0667  hypothetical protein  31.19 
 
 
252 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5300  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  30.11 
 
 
257 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0633  hypothetical protein  30.42 
 
 
253 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0667  hypothetical protein  30.04 
 
 
253 aa  95.5  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2674  hypothetical protein  26.2 
 
 
270 aa  85.5  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2141  ABC-type transport system, putative ATPase subunit  27.04 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00431135  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0678  hypothetical protein  29.52 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.661689  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1401  hypothetical protein  25.58 
 
 
271 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.441755 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0058  putative membrane bound transporter  25.91 
 
 
308 aa  63.5  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1499  hypothetical protein  22.87 
 
 
263 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2091  hypothetical protein  27.96 
 
 
264 aa  59.7  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.487971  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0790  hypothetical protein  27.46 
 
 
289 aa  55.8  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1659  hypothetical protein  25.47 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104222  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0462  hypothetical protein  24.46 
 
 
280 aa  53.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3750  hypothetical protein  30.94 
 
 
547 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2588  hypothetical protein  23.01 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0961  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  24.5 
 
 
292 aa  45.8  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169309  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1638  hypothetical protein  24.88 
 
 
264 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3279  hypothetical protein  29.91 
 
 
275 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94053  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0382  hypothetical protein  26.7 
 
 
290 aa  43.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.482052  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1808  hypothetical protein  35 
 
 
277 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.877505  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  29.57 
 
 
271 aa  42.7  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>