28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2141 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2141  ABC-type transport system, putative ATPase subunit  100 
 
 		 270 aa  526  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00431135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2674  hypothetical protein  61.11 
 
 		 270 aa  315  6e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1401  hypothetical protein  31.86 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.441755 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1638  hypothetical protein  34.98 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1499  hypothetical protein  29.1 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1659  hypothetical protein  30.5 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104222  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0041  ABC-2 type transporter  30.42 
 
 		 259 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2588  hypothetical protein  30.4 
 
 		 264 aa  98.6  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4688  hypothetical protein  31.67 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3793  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  30.42 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1572  hypothetical protein  30.19 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216442  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1612  putative efflux ABC transporter, permease protein PilI  29.07 
 
 		 257 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1587  hypothetical protein  29.07 
 
 		 257 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0210  hypothetical protein  29.45 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5300  type IV pilus biogenesis protein PilI-like protein  28.08 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0299  hypothetical protein  27.04 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2091  hypothetical protein  30.42 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.487971  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0667  hypothetical protein  22.59 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0633  hypothetical protein  22.79 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0667  hypothetical protein  35.79 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0678  hypothetical protein  38.89 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.661689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1992  hypothetical protein  23.71 
 
 		 308 aa  50.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.141259  normal  0.0904495 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0382  hypothetical protein  24.27 
 
 		 290 aa  46.2  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.482052  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1620  hypothetical protein  29.49 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.614587  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  31.19 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0790  hypothetical protein  31.08 
 
 		 289 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0784  hypothetical protein  34.78 
 
 		 286 aa  42.7  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3279  hypothetical protein  23.33 
 
 		 275 aa  42.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>