26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1620 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1620  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  496  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.614587  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1502  hypothetical protein  92.89 
 
 		 253 aa  408  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1366  hypothetical protein  84.19 
 
 		 253 aa  375  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0649  hypothetical protein  27.91 
 
 		 251 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0296  hypothetical protein  29.49 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1535  hypothetical protein  34.27 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3318  hypothetical protein  27.19 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1747  ABC-2 type transport system permease protein  28.25 
 
 		 260 aa  72  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600827  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1979  hypothetical protein  28.67 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1707  hypothetical protein  24.76 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3088  hypothetical protein  25.88 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.219174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3348  hypothetical protein  24.12 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3102  hypothetical protein  24.12 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2034  hypothetical protein  28.26 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0733845  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2114  hypothetical protein  27.15 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0351  hypothetical protein  28.95 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0041  ABC-2 type transporter  27.42 
 
 		 259 aa  45.4  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  27.96 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4528  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  27.27 
 
 		 322 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2002  hypothetical protein  21.56 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.577262  hitchhiker  0.00410102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2141  ABC-type transport system, putative ATPase subunit  29.49 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00431135  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  28.65 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 283 aa  42.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0784  hypothetical protein  30.28 
 
 		 286 aa  42.7  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  33.33 
 
 		 276 aa  42.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  34.58 
 
 		 273 aa  42  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>