106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2567 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  100 
 
 
276 aa  523  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  62.77 
 
 
275 aa  311  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  54.68 
 
 
276 aa  256  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  52.54 
 
 
272 aa  249  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  48.36 
 
 
272 aa  249  4e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  52.9 
 
 
272 aa  246  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  48.5 
 
 
275 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  53.45 
 
 
272 aa  216  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  60.26 
 
 
275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  48.19 
 
 
276 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  58.61 
 
 
275 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  44.65 
 
 
273 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  47.04 
 
 
271 aa  209  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  46.3 
 
 
271 aa  201  9e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  50.37 
 
 
271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  50.37 
 
 
271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  43.84 
 
 
275 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  48.34 
 
 
278 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  48.34 
 
 
278 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  48.34 
 
 
278 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  48.34 
 
 
278 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  43.48 
 
 
275 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  45.79 
 
 
274 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  48.01 
 
 
276 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  48.71 
 
 
278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  42.53 
 
 
292 aa  188  7e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  41.92 
 
 
274 aa  188  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  42.45 
 
 
275 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  46.52 
 
 
274 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  46.52 
 
 
274 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  42.6 
 
 
276 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  40.62 
 
 
276 aa  175  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  39.34 
 
 
279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  39.45 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  40.47 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  46.35 
 
 
276 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  46.35 
 
 
276 aa  162  8.000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  47.17 
 
 
273 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  42.7 
 
 
291 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 
271 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  39.77 
 
 
286 aa  157  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  42.54 
 
 
274 aa  152  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  43.19 
 
 
279 aa  152  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  39.11 
 
 
282 aa  149  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3993  copper ABC transporter, permease protein  43.54 
 
 
291 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  42.97 
 
 
295 aa  145  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  41.8 
 
 
295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  42.19 
 
 
295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  42.29 
 
 
274 aa  132  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  33.33 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  36.65 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  29.25 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0249  hypothetical protein  35.9 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  33.78 
 
 
280 aa  84  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  29.14 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  30.92 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0666  multi-copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component  24.38 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1721  ABC transporter  25.31 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  27.15 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  22.91 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00128273  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  34.85 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1562  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.35 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00415  normal  0.281318 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1561  hypothetical protein  37.01 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0263676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1466  hypothetical protein  36.51 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0697  nitrous-oxide metabolic protein NosY  27.27 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.168715  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.04 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  28.12 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  30 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  27.66 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 
290 aa  60.1  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5551  hypothetical protein  27.42 
 
 
270 aa  59.3  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756056  hitchhiker  0.000373453 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  24.86 
 
 
289 aa  59.3  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  31.1 
 
 
274 aa  59.3  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2397  hypothetical protein  37.86 
 
 
280 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32635  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1432  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  29.91 
 
 
328 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  27.94 
 
 
269 aa  56.2  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1215  hypothetical protein  28.09 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2968  copper ABC transporter permease  29.91 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557971  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  25.27 
 
 
294 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  26.88 
 
 
279 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  31.29 
 
 
359 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 
278 aa  52.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  20.86 
 
 
294 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0448  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  24.75 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  30 
 
 
318 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0075  ABC-2 type transporter  26.45 
 
 
283 aa  49.7  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  25 
 
 
286 aa  48.9  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  41.07 
 
 
265 aa  49.3  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  29.24 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2643  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 
276 aa  47  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.622049  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1625  ABC-2 type transporter  38.98 
 
 
326 aa  45.8  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0633194  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0725  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  33.07 
 
 
328 aa  45.8  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0961  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  30.13 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169309  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3208  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  34.96 
 
 
327 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0106078  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0452  nitrous-oxide metabolic protein NosY  24.75 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101154  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1043  ABC-2 type transporter  34.11 
 
 
254 aa  43.5  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  25.93 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>