57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1625 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1625  ABC-2 type transporter  100 
 
 
326 aa  622  1e-177  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0633194  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0457  ABC-2 type transporter  85.27 
 
 
324 aa  461  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1432  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  59.76 
 
 
328 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0725  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  62.15 
 
 
328 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3208  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  61.83 
 
 
327 aa  355  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0106078  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  57.46 
 
 
318 aa  349  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  46.08 
 
 
359 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  43.65 
 
 
321 aa  238  9e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2548  hypothetical protein  40.26 
 
 
310 aa  209  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  28.33 
 
 
289 aa  95.9  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.4 
 
 
307 aa  90.9  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  27 
 
 
301 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  26.37 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  28.34 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  35.27 
 
 
305 aa  75.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  26.89 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2072  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  25.22 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 
283 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2074  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  26.71 
 
 
354 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1412  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  26.09 
 
 
286 aa  62.4  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1341  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  22.8 
 
 
363 aa  62.4  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.207775  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0757  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  24.9 
 
 
367 aa  59.3  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  39.69 
 
 
274 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  34.25 
 
 
273 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2085  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  25.53 
 
 
400 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2165  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  42.03 
 
 
333 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0086  ABC-2 type transporter  24.4 
 
 
322 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  34.88 
 
 
276 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  30.86 
 
 
276 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  28.25 
 
 
275 aa  52.8  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  31.03 
 
 
275 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  33.08 
 
 
273 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4838  hypothetical protein  31.06 
 
 
286 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  29.65 
 
 
278 aa  50.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  30.46 
 
 
271 aa  50.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  35.61 
 
 
274 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  39.47 
 
 
271 aa  47.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  31.01 
 
 
275 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  34.11 
 
 
275 aa  45.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  31.3 
 
 
276 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  35.34 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4528  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  30.7 
 
 
322 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  31.3 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  34.26 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  35.34 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  26.32 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  31.43 
 
 
278 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  34.26 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  40.68 
 
 
278 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  45.1 
 
 
271 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0115  ABC-2 type transporter  35.21 
 
 
405 aa  43.1  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  37.5 
 
 
274 aa  43.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  38.98 
 
 
278 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  38.98 
 
 
278 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  29.55 
 
 
276 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  33.98 
 
 
278 aa  42.7  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>