54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2874 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  100 
 
 		 321 aa  642    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2548  hypothetical protein  72.26 
 
 		 310 aa  459  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  45.68 
 
 		 359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1432  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  41.36 
 
 		 328 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0725  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  41.03 
 
 		 328 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  40.37 
 
 		 318 aa  215  7e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3208  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  38.92 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0106078  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0457  ABC-2 type transporter  44.16 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1625  ABC-2 type transporter  43.65 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0633194  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  27.18 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  27.24 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.96 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.24 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  25.33 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  28.71 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  22.97 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0757  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  21.15 
 
 		 367 aa  69.3  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0086  ABC-2 type transporter  22.65 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2074  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  24.93 
 
 		 354 aa  62.4  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  25.91 
 
 		 286 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1412  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2072  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  22.35 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  22.81 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  23.7 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  32.31 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1341  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  27.78 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.207775  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  30.3 
 
 		 276 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  23.22 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  23.22 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  23.22 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  32.12 
 
 		 273 aa  53.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2165  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  24.5 
 
 		 333 aa  53.1  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  25.96 
 
 		 271 aa  52.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  27.56 
 
 		 278 aa  52.8  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  28.68 
 
 		 483 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300875  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  28.57 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2085  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  27.27 
 
 		 400 aa  50.4  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  24.64 
 
 		 272 aa  49.3  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  27.14 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  37.01 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  27.34 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  31.78 
 
 		 273 aa  45.8  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04086  hypothetical protein  25.27 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  25.6 
 
 		 272 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  24.54 
 
 		 277 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3117  hypothetical protein  25.81 
 
 		 760 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.247741  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  23.4 
 
 		 319 aa  43.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  27.27 
 
 		 276 aa  43.1  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  29.81 
 
 		 278 aa  43.1  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3359  hypothetical protein  26.62 
 
 		 491 aa  42.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  47.62 
 
 		 271 aa  42.4  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  27.27 
 
 		 276 aa  42.4  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>