104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2354 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  100 
 
 		 275 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  72.36 
 
 		 275 aa  361  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  72 
 
 		 275 aa  361  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  65.94 
 
 		 276 aa  318  7e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  65.22 
 
 		 276 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  61.59 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  61.59 
 
 		 276 aa  275  6e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  60.87 
 
 		 276 aa  269  5e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  42.45 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  45.13 
 
 		 272 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  44.04 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  40.07 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  41.82 
 
 		 275 aa  188  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  42.45 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  44.96 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  38.38 
 
 		 274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  45.61 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  46.69 
 
 		 275 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  46.69 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  39.47 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  43.12 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  38.38 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  48.85 
 
 		 274 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  40.51 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  42.16 
 
 		 274 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  40.07 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  40.22 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  39.49 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  39.49 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  40.22 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  39.71 
 
 		 271 aa  149  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  35.25 
 
 		 292 aa  148  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  41.49 
 
 		 278 aa  148  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  41.26 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  41.26 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  38.99 
 
 		 295 aa  139  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  37.18 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  38.27 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  36.86 
 
 		 279 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  37.27 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  40.52 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  40.52 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  38.71 
 
 		 295 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  34.93 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  40.18 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  35.94 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  34.3 
 
 		 283 aa  122  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3993  copper ABC transporter, permease protein  36.69 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  39.18 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  34.72 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  30.07 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  29.04 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0697  nitrous-oxide metabolic protein NosY  29.52 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.168715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.67 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00128273  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1721  ABC transporter  25.97 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  26.37 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0666  multi-copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component  23.66 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  31.9 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1215  hypothetical protein  27.27 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  29.02 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1562  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.43 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00415  normal  0.281318 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5551  hypothetical protein  28.24 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756056  hitchhiker  0.000373453 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  27.6 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  31.43 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.32 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  27.43 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  30.83 
 
 		 318 aa  53.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  34.19 
 
 		 265 aa  53.1  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.89 
 
 		 307 aa  52.8  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  27.76 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1432  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  28.8 
 
 		 328 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1561  hypothetical protein  35.04 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0263676  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  24.55 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0249  hypothetical protein  30.45 
 
 		 281 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  24.31 
 
 		 289 aa  48.9  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  30.3 
 
 		 277 aa  49.3  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1466  hypothetical protein  34.19 
 
 		 280 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  31.48 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  28.03 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2141  ABC-type transport system, putative ATPase subunit  31.19 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00431135  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  30.89 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2548  hypothetical protein  28.96 
 
 		 310 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  30.17 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5522  ABC transporter, permease protein  34.18 
 
 		 330 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5528  ABC transporter, permease protein  34.18 
 
 		 330 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2059  hypothetical protein  25.54 
 
 		 249 aa  46.2  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2674  hypothetical protein  28.44 
 
 		 270 aa  45.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  24.12 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2227  hypothetical protein  31.03 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0210  hypothetical protein  25.26 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0448  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  22.28 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3920  bacitracin transport permease protein BCRB  34.18 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0784  hypothetical protein  28.57 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  30.08 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1808  hypothetical protein  42 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.877505  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  33.08 
 
 		 242 aa  43.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  32.14 
 
 		 283 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>