93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1716 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  100 
 
 
283 aa  545  1e-154  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1718  hypothetical protein  41.13 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0404  hypothetical protein  32.39 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  31.37 
 
 
298 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  29.87 
 
 
319 aa  94.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3190  ABC-2 type transporter  28.62 
 
 
273 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 
298 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  27.21 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  25.52 
 
 
276 aa  89  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 
322 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  29.59 
 
 
283 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  31.45 
 
 
269 aa  85.5  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0891  copper ABC transporter permease  30.26 
 
 
278 aa  82  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.210065  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  27.99 
 
 
277 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  27.93 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0788  hypothetical protein  29.15 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1524  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 
623 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  27.15 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  29.29 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  30.22 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  27.76 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  30.04 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  27.12 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  27.24 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2941  nitrite/nitrate reduction protein  30.54 
 
 
300 aa  65.5  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3715  hypothetical protein  28.23 
 
 
280 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  27.76 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  31.58 
 
 
271 aa  62.4  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2227  hypothetical protein  29.56 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0075  ABC-2 type transporter  27.11 
 
 
283 aa  59.7  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.51 
 
 
301 aa  58.9  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  30.39 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  35.66 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  30.39 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  30.39 
 
 
278 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  30.39 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  24.41 
 
 
272 aa  56.2  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  25.49 
 
 
294 aa  55.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  25.87 
 
 
274 aa  54.3  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  28.72 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  28.72 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  29.21 
 
 
283 aa  53.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  29.18 
 
 
359 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.51 
 
 
307 aa  53.5  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  27.06 
 
 
294 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  26.17 
 
 
292 aa  52.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  29.68 
 
 
274 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  29.68 
 
 
274 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  28.73 
 
 
278 aa  52.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  30.28 
 
 
271 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  36.61 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2643  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 
276 aa  49.7  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.622049  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  36.45 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  34.88 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  34.95 
 
 
279 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  25.97 
 
 
276 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  31.58 
 
 
272 aa  47  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  25.24 
 
 
321 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3993  copper ABC transporter, permease protein  34.58 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  24.75 
 
 
272 aa  46.2  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  26.79 
 
 
276 aa  45.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  27.23 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3920  bacitracin transport permease protein BCRB  41.33 
 
 
330 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0642  multi- copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component-like protein  40.28 
 
 
356 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2486  hypothetical protein  25.32 
 
 
326 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4688  hypothetical protein  25.47 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583661  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  22.26 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  29.18 
 
 
274 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  31.48 
 
 
286 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  28.95 
 
 
276 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  34.13 
 
 
295 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  30.97 
 
 
281 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5192  bacitracin transport permease protein BCRB  38.03 
 
 
330 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  29.94 
 
 
273 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5528  ABC transporter, permease protein  47.62 
 
 
330 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2226  hypothetical protein  27.69 
 
 
281 aa  42.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2164  hypothetical protein  27.07 
 
 
292 aa  42.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.707618  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5578  ABC transporter, permease protein  47.62 
 
 
330 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  29.14 
 
 
275 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01817  hypothetical protein  29.57 
 
 
470 aa  42.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000241267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5522  ABC transporter, permease protein  47.62 
 
 
330 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  24.87 
 
 
275 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5097  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  47.62 
 
 
330 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  29.61 
 
 
332 aa  42.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  38.6 
 
 
276 aa  42.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5429  ABC transporter, permease protein  47.62 
 
 
330 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5649  ABC transporter permease  47.62 
 
 
330 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5494  ABC transporter, permease protein  47.62 
 
 
330 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5080  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  47.62 
 
 
330 aa  42.4  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0496537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5251  ABC transporter permease  47.62 
 
 
330 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>