51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2486 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2486  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  655    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1810  bacitracin transport permease protein BcrB  81.29 
 
 
326 aa  530  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5522  ABC transporter, permease protein  58.51 
 
 
330 aa  408  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5192  bacitracin transport permease protein BCRB  59.44 
 
 
330 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5528  ABC transporter, permease protein  57.89 
 
 
330 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5080  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  58.82 
 
 
330 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0496537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5494  ABC transporter, permease protein  58.82 
 
 
330 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5649  ABC transporter permease  58.2 
 
 
330 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5578  ABC transporter, permease protein  58.51 
 
 
330 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5429  ABC transporter, permease protein  58.33 
 
 
330 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5097  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  58.82 
 
 
330 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5251  ABC transporter permease  58.2 
 
 
330 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3920  bacitracin transport permease protein BCRB  58.77 
 
 
330 aa  385  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1543  bacitracin transport permease protein bcrb  28.44 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0441008 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3772  bacitracin transport permease protein bcrb  28.44 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3351  hypothetical protein  29.04 
 
 
315 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00531465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3420  bacitracin transport permease; ABC transporter, permease component  28.44 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000072807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3706  bacitracin transport permease; ABC transporter, permease  28.14 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3371  bacitracin transport permease; ABC transporter, permease  28.44 
 
 
314 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0164571  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3699  hypothetical protein  28.44 
 
 
314 aa  113  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3682  bacitracin transport permease  28.14 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0642  multi- copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component-like protein  28.17 
 
 
356 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02370  hypothetical protein  26.7 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2347  hypothetical protein  23.64 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0351  hypothetical protein  27.95 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1247  bacitracin ABC transporter, permease  27.52 
 
 
258 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00130672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1249  bacitracin ABC transporter, permease  27.06 
 
 
258 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0635173  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0608  putative ABC transporter integral membrane protein  34 
 
 
293 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037131 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1449  putative ABC transporter, permease protein  28.51 
 
 
258 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0130879 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1518  putative ABC transporter, permease protein  27.4 
 
 
258 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1282  ABC transporter, permease protein, putative  28.51 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137706  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1081  bacitracin transport permease protein BCRB  25.82 
 
 
258 aa  50.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1476  ABC transporter, permease protein, putative  36.76 
 
 
258 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0917  hypothetical protein  36.84 
 
 
273 aa  50.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.070186 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1275  ABC transporter permease  36.23 
 
 
258 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00493977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1377  ABC transporter permease  36.23 
 
 
258 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0512009  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0928  putative ABC transporter membrane protein  28.91 
 
 
294 aa  50.1  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.856372  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2337  hypothetical protein  26.36 
 
 
256 aa  49.7  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  40.24 
 
 
748 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  35.14 
 
 
736 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  30.83 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1411  putative ABC transporter, permease protein  39.13 
 
 
258 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4838  hypothetical protein  35.14 
 
 
286 aa  46.2  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0387  putative ABC transporter integral membrane protein  40 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5743  hypothetical protein  23.92 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2894  hypothetical protein  24.01 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00326074  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01660  hypothetical protein  46.94 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3764  hypothetical protein  39.71 
 
 
276 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0395526 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3067  membrane spanning protein  28.99 
 
 
250 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.688803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  35.38 
 
 
275 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  35.71 
 
 
276 aa  42.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>