52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1810 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1810  bacitracin transport permease protein BcrB  100 
 
 
326 aa  654    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2486  hypothetical protein  81.29 
 
 
326 aa  545  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5522  ABC transporter, permease protein  60.19 
 
 
330 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5528  ABC transporter, permease protein  59.88 
 
 
330 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5494  ABC transporter, permease protein  60.49 
 
 
330 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5080  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  60.49 
 
 
330 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0496537  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5429  ABC transporter, permease protein  60.49 
 
 
330 aa  418  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5251  ABC transporter permease  59.88 
 
 
330 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5192  bacitracin transport permease protein BCRB  60.06 
 
 
330 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5578  ABC transporter, permease protein  60.06 
 
 
330 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5649  ABC transporter permease  59.88 
 
 
330 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5097  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  59.88 
 
 
330 aa  413  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3920  bacitracin transport permease protein BCRB  60.19 
 
 
330 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3706  bacitracin transport permease; ABC transporter, permease  27.05 
 
 
314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3351  hypothetical protein  26.83 
 
 
315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00531465  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1543  bacitracin transport permease protein bcrb  26.52 
 
 
314 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0441008 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3772  bacitracin transport permease protein bcrb  26.52 
 
 
314 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3420  bacitracin transport permease; ABC transporter, permease component  26.75 
 
 
314 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000072807  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3371  bacitracin transport permease; ABC transporter, permease  26.75 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0164571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3682  bacitracin transport permease  27.13 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3699  hypothetical protein  26.75 
 
 
314 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0642  multi- copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component-like protein  29.25 
 
 
356 aa  94  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2347  hypothetical protein  29.55 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1282  ABC transporter, permease protein, putative  30.45 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1449  putative ABC transporter, permease protein  31.84 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0130879 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1081  bacitracin transport permease protein BCRB  28.75 
 
 
258 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1518  putative ABC transporter, permease protein  29.22 
 
 
258 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1247  bacitracin ABC transporter, permease  29.82 
 
 
258 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00130672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1249  bacitracin ABC transporter, permease  29.82 
 
 
258 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0635173  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02370  hypothetical protein  27.31 
 
 
283 aa  56.6  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1275  ABC transporter permease  30.49 
 
 
258 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00493977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1377  ABC transporter permease  30.49 
 
 
258 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0512009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1476  ABC transporter, permease protein, putative  45.59 
 
 
258 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2337  hypothetical protein  41.1 
 
 
256 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0608  putative ABC transporter integral membrane protein  35.71 
 
 
293 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037131 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0917  hypothetical protein  33.68 
 
 
273 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.070186 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0351  hypothetical protein  25.55 
 
 
256 aa  50.4  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1411  putative ABC transporter, permease protein  44.93 
 
 
258 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0928  putative ABC transporter membrane protein  26.92 
 
 
294 aa  47.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.856372  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2894  hypothetical protein  24.92 
 
 
325 aa  47.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00326074  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4838  hypothetical protein  29.13 
 
 
286 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5743  hypothetical protein  25.12 
 
 
317 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  35.14 
 
 
736 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  27.64 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0387  putative ABC transporter integral membrane protein  31.3 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3932  putative ABC transporter, permease protein  40.58 
 
 
258 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.743302 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3067  membrane spanning protein  30.66 
 
 
250 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.688803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6297  hypothetical protein  37.31 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0779  hypothetical protein  29.8 
 
 
288 aa  43.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6852  hypothetical protein  26.73 
 
 
303 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  40 
 
 
275 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  39.29 
 
 
748 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>