13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2337 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2337  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  474  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0917  hypothetical protein  63.5 
 
 
273 aa  280  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.070186 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1812  putative ABC-2 type transport system permease protein  50.97 
 
 
257 aa  169  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.807098  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02370  hypothetical protein  29.02 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5743  hypothetical protein  22.83 
 
 
317 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0351  hypothetical protein  26.84 
 
 
256 aa  52.4  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2486  hypothetical protein  26.36 
 
 
326 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2323  hypothetical protein  29.96 
 
 
283 aa  49.3  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.242923  normal  0.300348 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3067  membrane spanning protein  30.95 
 
 
250 aa  46.6  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.688803  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0608  putative ABC transporter integral membrane protein  26.89 
 
 
293 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037131 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2235  hypothetical protein  33.75 
 
 
295 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  31.78 
 
 
260 aa  42.4  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1355  ABC transporter integral membrane protein  29.07 
 
 
292 aa  42.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>