22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3067 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3067  membrane spanning protein  100 
 
 		 250 aa  489  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.688803  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2921  membrane spanning protein  55.02 
 
 		 250 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.993667  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2235  hypothetical protein  26.05 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5522  ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 		 330 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5528  ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 		 330 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0917  hypothetical protein  32.8 
 
 		 273 aa  52.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.070186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5743  hypothetical protein  29.29 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3920  bacitracin transport permease protein BCRB  26.88 
 
 		 330 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5192  bacitracin transport permease protein BCRB  28.93 
 
 		 330 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5578  ABC transporter, permease protein  28.3 
 
 		 330 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5494  ABC transporter, permease protein  28.3 
 
 		 330 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5429  ABC transporter, permease protein  28.3 
 
 		 330 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5649  ABC transporter permease  28.3 
 
 		 330 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5097  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  28.3 
 
 		 330 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5080  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  28.3 
 
 		 330 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0496537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5251  ABC transporter permease  28.3 
 
 		 330 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1812  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.04 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.807098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02370  hypothetical protein  23.67 
 
 		 283 aa  50.1  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2337  hypothetical protein  34.04 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2486  hypothetical protein  28.99 
 
 		 326 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1810  bacitracin transport permease protein BcrB  30.66 
 
 		 326 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367153  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3371  bacitracin transport permease; ABC transporter, permease  23.45 
 
 		 314 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0164571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>