32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2235 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2235  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  575  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5743  hypothetical protein  43.17 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6156  hypothetical protein  39.31 
 
 		 457 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.416994  normal  0.477374 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02370  hypothetical protein  25.9 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3067  membrane spanning protein  26.05 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.688803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4838  hypothetical protein  26.85 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2323  hypothetical protein  26.7 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.242923  normal  0.300348 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3371  bacitracin transport permease; ABC transporter, permease  29.68 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0164571  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3699  hypothetical protein  29.68 
 
 		 314 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0608  putative ABC transporter integral membrane protein  26.29 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037131 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3682  bacitracin transport permease  29.49 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3420  bacitracin transport permease; ABC transporter, permease component  29.22 
 
 		 314 aa  53.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000072807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3706  bacitracin transport permease; ABC transporter, permease  29.22 
 
 		 314 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3351  hypothetical protein  28.77 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00531465  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1543  bacitracin transport permease protein bcrb  28.57 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0441008 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0917  hypothetical protein  31.34 
 
 		 273 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.070186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3028  hypothetical protein  25.96 
 
 		 307 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0101124  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3772  bacitracin transport permease protein bcrb  28.57 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6852  hypothetical protein  23.97 
 
 		 303 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3300  putative ABC transporter membrane protein  32.43 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337957  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0387  putative ABC transporter integral membrane protein  25.75 
 
 		 296 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0779  hypothetical protein  24.39 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2337  hypothetical protein  33.75 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0297  hypothetical protein  24.5 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1355  ABC transporter integral membrane protein  30.22 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3426  hypothetical protein  28.28 
 
 		 300 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0257  hypothetical protein  25.94 
 
 		 299 aa  45.8  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.504314  normal  0.0342583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5515  hypothetical protein  25.82 
 
 		 327 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01660  hypothetical protein  24.63 
 
 		 301 aa  43.1  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2612  hypothetical protein  30.37 
 
 		 278 aa  42.7  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0496634 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0928  putative ABC transporter membrane protein  27.32 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.856372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0856  ABC transporter membrane protein  25.77 
 
 		 245 aa  42.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.705558  normal  0.0105527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>