28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0257 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0257  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  570  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.504314  normal  0.0342583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0297  hypothetical protein  93.98 
 
 		 299 aa  496  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0441  hypothetical protein  58.1 
 
 		 296 aa  275  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6527  ABC transporter integral membrane protein  54.09 
 
 		 314 aa  265  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0483782  normal  0.177789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0779  hypothetical protein  51.59 
 
 		 288 aa  250  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3028  hypothetical protein  54.61 
 
 		 307 aa  245  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0101124  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6852  hypothetical protein  49.15 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5515  hypothetical protein  52.84 
 
 		 327 aa  229  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2323  hypothetical protein  51.96 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.242923  normal  0.300348 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25850  hypothetical protein  50.88 
 
 		 316 aa  208  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1355  ABC transporter integral membrane protein  47.57 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5743  hypothetical protein  33.92 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4838  hypothetical protein  32.33 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0928  putative ABC transporter membrane protein  32.1 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.856372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0608  putative ABC transporter integral membrane protein  33.46 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037131 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0387  putative ABC transporter integral membrane protein  30.42 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6297  hypothetical protein  28.85 
 
 		 294 aa  85.9  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3426  hypothetical protein  32.84 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01660  hypothetical protein  27.44 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3300  putative ABC transporter membrane protein  32.22 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337957  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1291  putative ABC transporter integral membrane protein  32.09 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  hitchhiker  0.00415564 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02370  hypothetical protein  29.22 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2235  hypothetical protein  24.91 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2337  hypothetical protein  32.87 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0856  ABC transporter membrane protein  32.72 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.705558  normal  0.0105527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0749  hypothetical protein  38.18 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  28.28 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  28.88 
 
 		 283 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>