40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0856 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0856  ABC transporter membrane protein  100 
 
 		 245 aa  465  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.705558  normal  0.0105527 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0608  putative ABC transporter integral membrane protein  48.94 
 
 		 293 aa  198  7e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037131 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0387  putative ABC transporter integral membrane protein  45.68 
 
 		 296 aa  193  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0928  putative ABC transporter membrane protein  46.12 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.856372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3426  hypothetical protein  47.15 
 
 		 300 aa  148  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1291  putative ABC transporter integral membrane protein  42.61 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  hitchhiker  0.00415564 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01660  hypothetical protein  38.52 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4838  hypothetical protein  37.83 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3300  putative ABC transporter membrane protein  41.15 
 
 		 270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6297  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1205  ABC transporter integral membrane protein  40.17 
 
 		 266 aa  99  6e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0749  hypothetical protein  35.54 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5743  hypothetical protein  31.58 
 
 		 317 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2323  hypothetical protein  30.13 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.242923  normal  0.300348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6852  hypothetical protein  33.62 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6527  ABC transporter integral membrane protein  30.77 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0483782  normal  0.177789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0779  hypothetical protein  31.73 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3028  hypothetical protein  25.41 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0101124  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25850  hypothetical protein  30.05 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02370  hypothetical protein  22.71 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0441  hypothetical protein  27.96 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1355  ABC transporter integral membrane protein  29.15 
 
 		 292 aa  62  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5515  hypothetical protein  25.11 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2235  hypothetical protein  25.77 
 
 		 295 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0297  hypothetical protein  30.28 
 
 		 299 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5192  bacitracin transport permease protein BCRB  28.3 
 
 		 330 aa  46.2  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3067  membrane spanning protein  25 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.688803  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5097  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  26.34 
 
 		 330 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0257  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.504314  normal  0.0342583 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5429  ABC transporter, permease protein  27.67 
 
 		 330 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5522  ABC transporter, permease protein  27.67 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5528  ABC transporter, permease protein  26.34 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3920  bacitracin transport permease protein BCRB  27.04 
 
 		 330 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1810  bacitracin transport permease protein BcrB  27.65 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367153  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5578  ABC transporter, permease protein  25.89 
 
 		 330 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2486  hypothetical protein  38.03 
 
 		 326 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5080  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  27.04 
 
 		 330 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0496537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5494  ABC transporter, permease protein  27.04 
 
 		 330 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5649  ABC transporter permease  40 
 
 		 330 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5251  ABC transporter permease  40 
 
 		 330 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>