26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0441 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0441  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  580  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0297  hypothetical protein  59.25 
 
 		 299 aa  296  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0257  hypothetical protein  58.3 
 
 		 299 aa  272  5.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.504314  normal  0.0342583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6527  ABC transporter integral membrane protein  50.88 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0483782  normal  0.177789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3028  hypothetical protein  49.51 
 
 		 307 aa  235  6e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0101124  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0779  hypothetical protein  47.99 
 
 		 288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6852  hypothetical protein  46.23 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5515  hypothetical protein  49.82 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2323  hypothetical protein  50.35 
 
 		 283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.242923  normal  0.300348 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1355  ABC transporter integral membrane protein  46.6 
 
 		 292 aa  207  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25850  hypothetical protein  43.1 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0928  putative ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.856372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4838  hypothetical protein  30.34 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0387  putative ABC transporter integral membrane protein  31.62 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0608  putative ABC transporter integral membrane protein  33.21 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6297  hypothetical protein  29.26 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5743  hypothetical protein  29.63 
 
 		 317 aa  96.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01660  hypothetical protein  28.73 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3426  hypothetical protein  32.35 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3300  putative ABC transporter membrane protein  33.7 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337957  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1291  putative ABC transporter integral membrane protein  30.82 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  hitchhiker  0.00415564 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02370  hypothetical protein  28.7 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0856  ABC transporter membrane protein  28.1 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.705558  normal  0.0105527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0749  hypothetical protein  34.64 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2235  hypothetical protein  21.43 
 
 		 295 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2337  hypothetical protein  29.07 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>