25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25850 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_25850  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5515  hypothetical protein  62.54 
 
 		 327 aa  360  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6527  ABC transporter integral membrane protein  50.88 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0483782  normal  0.177789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0779  hypothetical protein  49.3 
 
 		 288 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3028  hypothetical protein  49.67 
 
 		 307 aa  242  6e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0101124  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0297  hypothetical protein  50.18 
 
 		 299 aa  221  9e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6852  hypothetical protein  44.63 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0257  hypothetical protein  50.88 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.504314  normal  0.0342583 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1355  ABC transporter integral membrane protein  45.91 
 
 		 292 aa  203  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2323  hypothetical protein  45.29 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.242923  normal  0.300348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0441  hypothetical protein  43.79 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0387  putative ABC transporter integral membrane protein  32.83 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4838  hypothetical protein  34.07 
 
 		 286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0608  putative ABC transporter integral membrane protein  34.34 
 
 		 293 aa  112  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037131 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0928  putative ABC transporter membrane protein  32.32 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.856372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01660  hypothetical protein  30.71 
 
 		 301 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1291  putative ABC transporter integral membrane protein  31.74 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  hitchhiker  0.00415564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6297  hypothetical protein  29.21 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3300  putative ABC transporter membrane protein  32.6 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5743  hypothetical protein  27.87 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3426  hypothetical protein  28.2 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02370  hypothetical protein  24.29 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0856  ABC transporter membrane protein  30.05 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.705558  normal  0.0105527 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2235  hypothetical protein  23.86 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3371  bacitracin transport permease; ABC transporter, permease  24.36 
 
 		 314 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0164571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>