26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5515 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5515  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  647    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25850  hypothetical protein  62.54 
 
 		 316 aa  348  5e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3028  hypothetical protein  57.73 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0101124  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6527  ABC transporter integral membrane protein  49.82 
 
 		 314 aa  238  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0483782  normal  0.177789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0779  hypothetical protein  46.13 
 
 		 288 aa  231  9e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0297  hypothetical protein  52.8 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1355  ABC transporter integral membrane protein  48.04 
 
 		 292 aa  226  6e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6852  hypothetical protein  47.04 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0257  hypothetical protein  52.45 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.504314  normal  0.0342583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2323  hypothetical protein  48.19 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.242923  normal  0.300348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0441  hypothetical protein  49.82 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4838  hypothetical protein  33.92 
 
 		 286 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0387  putative ABC transporter integral membrane protein  33.97 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0928  putative ABC transporter membrane protein  33.58 
 
 		 294 aa  116  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.856372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01660  hypothetical protein  30.2 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0608  putative ABC transporter integral membrane protein  32.55 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037131 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1291  putative ABC transporter integral membrane protein  32.88 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  hitchhiker  0.00415564 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5743  hypothetical protein  32.45 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6297  hypothetical protein  33.08 
 
 		 294 aa  92.4  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3426  hypothetical protein  32.2 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3300  putative ABC transporter membrane protein  34.07 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02370  hypothetical protein  27.27 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0749  hypothetical protein  29.33 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2235  hypothetical protein  25.27 
 
 		 295 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0856  ABC transporter membrane protein  25.59 
 
 		 245 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.705558  normal  0.0105527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6156  hypothetical protein  29.55 
 
 		 457 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.416994  normal  0.477374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>