31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0779 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0779  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  559  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6527  ABC transporter integral membrane protein  50.18 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0483782  normal  0.177789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0297  hypothetical protein  52.3 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1355  ABC transporter integral membrane protein  48.96 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3028  hypothetical protein  49.3 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0101124  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6852  hypothetical protein  47.69 
 
 		 303 aa  228  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25850  hypothetical protein  49.3 
 
 		 316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0257  hypothetical protein  51.93 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.504314  normal  0.0342583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2323  hypothetical protein  47.87 
 
 		 283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.242923  normal  0.300348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5515  hypothetical protein  46.13 
 
 		 327 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0441  hypothetical protein  47.99 
 
 		 296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4838  hypothetical protein  31.02 
 
 		 286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0928  putative ABC transporter membrane protein  29.92 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.856372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0387  putative ABC transporter integral membrane protein  30.74 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5743  hypothetical protein  30.91 
 
 		 317 aa  96.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01660  hypothetical protein  31.46 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0608  putative ABC transporter integral membrane protein  30.57 
 
 		 293 aa  89  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6297  hypothetical protein  28.9 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3300  putative ABC transporter membrane protein  33.21 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337957  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1291  putative ABC transporter integral membrane protein  33.64 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  hitchhiker  0.00415564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3426  hypothetical protein  29.45 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02370  hypothetical protein  30.14 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0856  ABC transporter membrane protein  31.73 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.705558  normal  0.0105527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0749  hypothetical protein  28.18 
 
 		 288 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2347  hypothetical protein  26.09 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1449  putative ABC transporter, permease protein  28.87 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0130879 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1243  hypothetical protein  28.48 
 
 		 285 aa  43.5  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2235  hypothetical protein  26.27 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1377  ABC transporter permease  26.76 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0512009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1275  ABC transporter permease  26.76 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00493977  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1810  bacitracin transport permease protein BcrB  29.61 
 
 		 326 aa  42.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>