26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0749 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0749  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  538  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4838  hypothetical protein  39.38 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0387  putative ABC transporter integral membrane protein  37.91 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0928  putative ABC transporter membrane protein  36.02 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.856372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3426  hypothetical protein  39.62 
 
 		 300 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6297  hypothetical protein  34.5 
 
 		 294 aa  119  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0608  putative ABC transporter integral membrane protein  35 
 
 		 293 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037131 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1291  putative ABC transporter integral membrane protein  41.15 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  hitchhiker  0.00415564 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01660  hypothetical protein  37.77 
 
 		 301 aa  105  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0856  ABC transporter membrane protein  34.74 
 
 		 245 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.705558  normal  0.0105527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3300  putative ABC transporter membrane protein  38.02 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5743  hypothetical protein  28.17 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0779  hypothetical protein  28.18 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5515  hypothetical protein  29.51 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2323  hypothetical protein  28.42 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.242923  normal  0.300348 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3028  hypothetical protein  27.02 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0101124  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6527  ABC transporter integral membrane protein  31.09 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0483782  normal  0.177789 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02370  hypothetical protein  27.82 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1205  ABC transporter integral membrane protein  32.06 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1355  ABC transporter integral membrane protein  31.16 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6852  hypothetical protein  24.91 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25850  hypothetical protein  30.99 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0297  hypothetical protein  27.27 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0441  hypothetical protein  35.29 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0257  hypothetical protein  27.65 
 
 		 299 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.504314  normal  0.0342583 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3067  membrane spanning protein  30.23 
 
 		 250 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.688803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>