28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1355 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1355  ABC transporter integral membrane protein  100 
 
 		 292 aa  552  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0779  hypothetical protein  48.96 
 
 		 288 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6852  hypothetical protein  49.65 
 
 		 303 aa  245  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2323  hypothetical protein  52.69 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.242923  normal  0.300348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6527  ABC transporter integral membrane protein  50.35 
 
 		 314 aa  232  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0483782  normal  0.177789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5515  hypothetical protein  48.04 
 
 		 327 aa  219  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3028  hypothetical protein  45.91 
 
 		 307 aa  209  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0101124  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0441  hypothetical protein  46.6 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0297  hypothetical protein  47.92 
 
 		 299 aa  205  8e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25850  hypothetical protein  45.91 
 
 		 316 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0257  hypothetical protein  47.57 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.504314  normal  0.0342583 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0928  putative ABC transporter membrane protein  31.62 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.856372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4838  hypothetical protein  32.52 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0387  putative ABC transporter integral membrane protein  33.78 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01660  hypothetical protein  31.25 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6297  hypothetical protein  32.05 
 
 		 294 aa  92  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0608  putative ABC transporter integral membrane protein  31.46 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3426  hypothetical protein  33.58 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3300  putative ABC transporter membrane protein  34.7 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5743  hypothetical protein  28.52 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1291  putative ABC transporter integral membrane protein  31.6 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  hitchhiker  0.00415564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0856  ABC transporter membrane protein  28.9 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.705558  normal  0.0105527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0749  hypothetical protein  31.16 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02370  hypothetical protein  22.58 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2235  hypothetical protein  30.97 
 
 		 295 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2337  hypothetical protein  29.18 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1205  ABC transporter integral membrane protein  28.41 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  37.17 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>