28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1205 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1205  ABC transporter integral membrane protein  100 
 
 		 266 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0928  putative ABC transporter membrane protein  38.58 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.856372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0387  putative ABC transporter integral membrane protein  36.09 
 
 		 296 aa  152  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4838  hypothetical protein  37.5 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0608  putative ABC transporter integral membrane protein  36.88 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037131 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01660  hypothetical protein  41.83 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3426  hypothetical protein  38.26 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0856  ABC transporter membrane protein  39.75 
 
 		 245 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.705558  normal  0.0105527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3300  putative ABC transporter membrane protein  39.47 
 
 		 270 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337957  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1291  putative ABC transporter integral membrane protein  41.83 
 
 		 293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  hitchhiker  0.00415564 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5743  hypothetical protein  29.96 
 
 		 317 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6297  hypothetical protein  28.68 
 
 		 294 aa  89.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1355  ABC transporter integral membrane protein  29.55 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6527  ABC transporter integral membrane protein  31.2 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0483782  normal  0.177789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0749  hypothetical protein  31.94 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6852  hypothetical protein  30.37 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0779  hypothetical protein  25.75 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5515  hypothetical protein  25.55 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2323  hypothetical protein  31.44 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.242923  normal  0.300348 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25850  hypothetical protein  23.29 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02370  hypothetical protein  23.9 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0441  hypothetical protein  25.19 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3067  membrane spanning protein  23.77 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.688803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6156  hypothetical protein  28.25 
 
 		 457 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.416994  normal  0.477374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0297  hypothetical protein  25.93 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2235  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2486  hypothetical protein  29.7 
 
 		 326 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3028  hypothetical protein  24.19 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0101124  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>